More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3111 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  95.59 
 
 
290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  94.24 
 
 
285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  94.24 
 
 
285 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  93.22 
 
 
285 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  83.73 
 
 
285 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  82.71 
 
 
285 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  82.71 
 
 
285 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  81.36 
 
 
285 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  69.73 
 
 
293 aa  433  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  65.54 
 
 
288 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  65.65 
 
 
286 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  62.16 
 
 
288 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2994  pirin family protein  61.9 
 
 
284 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1771  pirin family protein  53.9 
 
 
277 aa  309  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  42.07 
 
 
282 aa  235  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000589  pirin-related protein  42.4 
 
 
282 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0425395  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06417  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 
282 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  43.25 
 
 
282 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  41.26 
 
 
283 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  40.28 
 
 
284 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  39.25 
 
 
284 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1135  Pirin-like protein  42.25 
 
 
282 aa  209  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  40.69 
 
 
284 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  40.07 
 
 
289 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  35.57 
 
 
301 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  35.43 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  40 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  35.55 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  39.73 
 
 
284 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.38 
 
 
284 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  34.88 
 
 
303 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  34.68 
 
 
303 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  38.23 
 
 
286 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  37.24 
 
 
285 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  34.36 
 
 
290 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  36.77 
 
 
298 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  37.19 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  37.01 
 
 
283 aa  182  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  36.15 
 
 
298 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  39.07 
 
 
299 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  36.86 
 
 
298 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  37.37 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  35.84 
 
 
277 aa  178  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  34.26 
 
 
283 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  33.67 
 
 
302 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  35.74 
 
 
283 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  31.56 
 
 
303 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  33.33 
 
 
301 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  32.99 
 
 
312 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  33.57 
 
 
285 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  35.99 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  37.14 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  35.71 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  34.35 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  37.02 
 
 
307 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  35.94 
 
 
279 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  35.71 
 
 
287 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  33.33 
 
 
294 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  32.79 
 
 
300 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  34.51 
 
 
286 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  34.01 
 
 
280 aa  169  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  32.99 
 
 
279 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  34.4 
 
 
286 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  32.21 
 
 
309 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  34.04 
 
 
286 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  31.44 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  31.44 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  33.56 
 
 
283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  33.81 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  31.88 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  32.98 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  34.86 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  34.74 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  34.74 
 
 
290 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  35.74 
 
 
322 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  34.74 
 
 
290 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  34.87 
 
 
318 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  33.78 
 
 
293 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  38.15 
 
 
290 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  36.24 
 
 
290 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  35.29 
 
 
294 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  33.22 
 
 
302 aa  159  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  35.09 
 
 
278 aa  158  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  36.27 
 
 
290 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  32.33 
 
 
279 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  36.27 
 
 
290 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  35.81 
 
 
290 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  35.14 
 
 
290 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  35.14 
 
 
290 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  35.14 
 
 
290 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 
290 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  36.82 
 
 
290 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  35.47 
 
 
290 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  35.47 
 
 
290 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  35.47 
 
 
290 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  37.64 
 
 
290 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  33.66 
 
 
346 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  36.15 
 
 
292 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  32.05 
 
 
331 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>