More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3538 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  100 
 
 
282 aa  578  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  86.52 
 
 
282 aa  501  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  63.7 
 
 
286 aa  361  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  44.32 
 
 
287 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  44.09 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  43.43 
 
 
289 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  43.43 
 
 
289 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  43.43 
 
 
289 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  43.08 
 
 
290 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  40.71 
 
 
286 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  43.7 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  44.49 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  40.32 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  40.32 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  40.32 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  43.43 
 
 
293 aa  212  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  40.32 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  42.52 
 
 
288 aa  212  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  43.03 
 
 
286 aa  211  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  42.13 
 
 
288 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  42.16 
 
 
290 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  43.7 
 
 
305 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  43.36 
 
 
292 aa  209  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  42.52 
 
 
288 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  40.08 
 
 
287 aa  208  8e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  43.03 
 
 
288 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  43.03 
 
 
288 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  43.03 
 
 
288 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  43.7 
 
 
291 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  43.65 
 
 
287 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  42.38 
 
 
290 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  43.03 
 
 
288 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  43.03 
 
 
288 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  43.03 
 
 
288 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  43.03 
 
 
288 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  44.62 
 
 
303 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  41.32 
 
 
292 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  43.31 
 
 
295 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  41.87 
 
 
292 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  38.35 
 
 
286 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  41.18 
 
 
293 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  42.91 
 
 
295 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  41.46 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  41.46 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  42.52 
 
 
288 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  41.46 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  42.01 
 
 
290 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  42.01 
 
 
290 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  42.52 
 
 
288 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  42.13 
 
 
288 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  42.52 
 
 
288 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  42.01 
 
 
290 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  42.13 
 
 
288 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  42.75 
 
 
290 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  42.58 
 
 
290 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  42.86 
 
 
288 aa  202  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  42.01 
 
 
290 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  42.38 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  42.29 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  42.4 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  42.96 
 
 
337 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  40.55 
 
 
295 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  41.11 
 
 
288 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  41.26 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  41.6 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  40.89 
 
 
290 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  40.89 
 
 
290 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  36.4 
 
 
290 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  40.4 
 
 
286 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  38.8 
 
 
286 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1938  pirin family protein  38.04 
 
 
288 aa  188  8e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0765198  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  38.34 
 
 
288 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  36.36 
 
 
293 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  39 
 
 
337 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  41.47 
 
 
307 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5014  Pirin domain protein  36.92 
 
 
286 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  40.67 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  39.41 
 
 
294 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  40.77 
 
 
274 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  38.75 
 
 
298 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  38.46 
 
 
310 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0677  hypothetical protein  34.27 
 
 
293 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  38.62 
 
 
298 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  38.28 
 
 
298 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  38.58 
 
 
346 aa  175  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  39.29 
 
 
293 aa  175  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  38.01 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  38.76 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  39.92 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  39.92 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  35.51 
 
 
287 aa  172  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  37.5 
 
 
311 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  37.55 
 
 
294 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  38.85 
 
 
299 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  37.17 
 
 
322 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  37.46 
 
 
324 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  38.06 
 
 
286 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  41.13 
 
 
283 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  39.47 
 
 
285 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  39.86 
 
 
284 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>