More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5014 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5014  Pirin domain protein  100 
 
 
286 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  40.77 
 
 
282 aa  195  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  37.15 
 
 
290 aa  186  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  38.49 
 
 
288 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  36.51 
 
 
289 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  36.51 
 
 
289 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  36.51 
 
 
289 aa  185  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  38.74 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  38.74 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  38.74 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  38.74 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  38.74 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  38.74 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  38.74 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  36.92 
 
 
282 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  38.1 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  34.92 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  34.92 
 
 
286 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  36.22 
 
 
288 aa  182  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  34.92 
 
 
286 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  34.92 
 
 
286 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  34.92 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  37.55 
 
 
288 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  37.3 
 
 
288 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  35.02 
 
 
337 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  36.76 
 
 
293 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  37.7 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  36.76 
 
 
292 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  35.32 
 
 
288 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  37.4 
 
 
290 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  36.4 
 
 
290 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  35.57 
 
 
293 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  37.3 
 
 
288 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  38.1 
 
 
288 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  35.25 
 
 
287 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  37.7 
 
 
288 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  37.7 
 
 
288 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  36.43 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  36.61 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  37.15 
 
 
305 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  36.25 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  35.74 
 
 
286 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  35.94 
 
 
293 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  34.57 
 
 
288 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  36.47 
 
 
286 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  33.85 
 
 
286 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  35.74 
 
 
286 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  33.73 
 
 
287 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  36.25 
 
 
287 aa  165  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  34.52 
 
 
293 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  34.39 
 
 
303 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  34.52 
 
 
295 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  33.73 
 
 
295 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  32.81 
 
 
291 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  33.73 
 
 
295 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1938  pirin family protein  32.48 
 
 
288 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  36.19 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  33.58 
 
 
290 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  33.98 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  33.22 
 
 
287 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  34.53 
 
 
304 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  33.46 
 
 
311 aa  149  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  32.71 
 
 
290 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  32.14 
 
 
290 aa  148  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  30 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  34.23 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  33.33 
 
 
284 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  33.59 
 
 
315 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  38.6 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  32.47 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  31.71 
 
 
290 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  33.59 
 
 
324 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  31.71 
 
 
290 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  34.33 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  32.96 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  31.85 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  30.71 
 
 
307 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  33.97 
 
 
328 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  33.97 
 
 
328 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  33.97 
 
 
328 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  31.5 
 
 
320 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  32.2 
 
 
307 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  33.6 
 
 
293 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  32.54 
 
 
284 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  33.21 
 
 
342 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  32.16 
 
 
294 aa  142  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  33.08 
 
 
290 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  32.44 
 
 
310 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  34.23 
 
 
323 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  31.09 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  34.8 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  31.27 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  31.25 
 
 
290 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  30.6 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  34.36 
 
 
346 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  30.6 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  31.95 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  32.71 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  30.6 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  32.71 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>