More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6985 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  100 
 
 
287 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  43.94 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  44.32 
 
 
282 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  46.21 
 
 
286 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  42.29 
 
 
288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  41.5 
 
 
292 aa  214  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  42.34 
 
 
295 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  42.02 
 
 
293 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  42.34 
 
 
295 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  42.29 
 
 
288 aa  208  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  40.32 
 
 
288 aa  208  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  41.53 
 
 
290 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  41.94 
 
 
295 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  41 
 
 
293 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  42.29 
 
 
288 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  42.17 
 
 
286 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  40.71 
 
 
288 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  39.61 
 
 
293 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  42.17 
 
 
286 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  41.38 
 
 
286 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  42.17 
 
 
286 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  42.17 
 
 
286 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  41 
 
 
288 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  40.23 
 
 
289 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  40.23 
 
 
289 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  41 
 
 
288 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  40.23 
 
 
289 aa  201  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  41 
 
 
288 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  41 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  41 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  41.44 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  40.61 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  39.68 
 
 
291 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  39.13 
 
 
290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  40.71 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  40.8 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  39.25 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  39.13 
 
 
288 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  39.13 
 
 
288 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  39.13 
 
 
288 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  39.13 
 
 
288 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  39.13 
 
 
288 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  39.13 
 
 
288 aa  195  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  39.13 
 
 
288 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  41.11 
 
 
288 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  39.53 
 
 
288 aa  194  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  39.31 
 
 
293 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  39.2 
 
 
290 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  37.3 
 
 
287 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  35.82 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  39.53 
 
 
293 aa  189  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  39.68 
 
 
303 aa  188  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  37.45 
 
 
286 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  37.45 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  38.2 
 
 
290 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1938  pirin family protein  37.4 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0765198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  37.25 
 
 
286 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5014  Pirin domain protein  35.25 
 
 
286 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  37.55 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  34.83 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  38.66 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  37.05 
 
 
293 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  38.29 
 
 
311 aa  170  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  35.06 
 
 
290 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  35.06 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  35.21 
 
 
290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  36.46 
 
 
303 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  35.58 
 
 
290 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  35.58 
 
 
290 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  36.4 
 
 
294 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  35.58 
 
 
290 aa  163  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  34.83 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  34.46 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  33.91 
 
 
287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  37.18 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  35.58 
 
 
290 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  35.58 
 
 
290 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  35.58 
 
 
290 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  34.49 
 
 
294 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  35.21 
 
 
290 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  35.21 
 
 
290 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.53 
 
 
284 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  33.88 
 
 
303 aa  158  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  34.75 
 
 
299 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  37.6 
 
 
284 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  37.5 
 
 
298 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  35.6 
 
 
290 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  35.6 
 
 
290 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  37.88 
 
 
298 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  32.53 
 
 
320 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  33.45 
 
 
290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.51 
 
 
304 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  37.94 
 
 
285 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  37.13 
 
 
301 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  38.7 
 
 
283 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  34.88 
 
 
288 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  36.54 
 
 
298 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  37.4 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  37.55 
 
 
299 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0677  hypothetical protein  32.95 
 
 
293 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>