94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02080 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02080  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  100 
 
 		 313 aa  603  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2408  Polysulphide reductase NrfD  40.76 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00574451  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1872  Polysulphide reductase NrfD  33.76 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2389  Polysulphide reductase NrfD  35.39 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.28599 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2377  Polysulphide reductase NrfD  41.08 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.496727 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2456  Polysulphide reductase NrfD  32.49 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  26.33 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0309  Polysulphide reductase NrfD  24.7 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000856639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  27.73 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  27.85 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  29.59 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2917  Polysulphide reductase NrfD  30.97 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  28.01 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  32.14 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0271  Polysulphide reductase NrfD  30.99 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  28.48 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  29.75 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  28.05 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0936  polysulphide reductase, NrfD  30.17 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00000369278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  25.32 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  31.17 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  25.44 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  29.18 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.35 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  27.33 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0658  Polysulphide reductase NrfD  34.97 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.245596  hitchhiker  0.00748855 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1636  Polysulphide reductase NrfD  30.74 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.280095  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4539  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  29.38 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.19 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  26.65 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1874  polysulphide reductase, NrfD  28.67 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03905  hypothetical protein  30.34 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4629  nrfD protein  30.34 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3919  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  30.34 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4318  nrfD protein  30.34 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03945  formate-dependent nitrite reductase, membrane subunit  30.34 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  30.17 
 
 		 314 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4594  nrfD protein  30.34 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  29.78 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4535  nrfD protein  30.34 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3954  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  30.34 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.790103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  30.99 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  32.3 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  31.36 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  30.61 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16800  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  28.23 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1888  Polysulphide reductase NrfD  26.67 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  25.75 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4532  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.9 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  29.26 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  28.02 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  30.86 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3178  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  33.75 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  30.56 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  30.34 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1123  polysulphide reductase, NrfD  29.17 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1637  Polysulphide reductase NrfD  26.88 
 
 		 285 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000405044  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  29.15 
 
 		 331 aa  49.3  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0700  Polysulphide reductase NrfD  27.5 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000375278  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1498  polysulphide reductase, NrfD  30 
 
 		 290 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00036667 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  31.67 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0498  polysulphide reductase, NrfD  26.1 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1367  Polysulphide reductase NrfD  33.96 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4674  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.32 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0243  polysulphide reductase, NrfD  25.77 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4623  cytochrome c nitrite reductase NrfD subunit  28.9 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.872874  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2388  Polysulphide reductase NrfD  28.52 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4625  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.32 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  28.26 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  27.04 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3984  polysulphide reductase, NrfD  23.26 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0933  Polysulphide reductase NrfD  28.11 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.702618  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3965  polysulphide reductase NrfD  28.53 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  30.89 
 
 		 347 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0055  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.98 
 
 		 515 aa  46.2  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3617  polysulphide reductase, NrfD  31.07 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  25.36 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0613  polysulphide reductase, NrfD  30.51 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4060  polysulfide reductase, subunit C  31.07 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3561  polysulphide reductase, NrfD  32.3 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  28.9 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  26.6 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  28.4 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0533  polysulphide reductase NrfD  30.51 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0557  polysulphide reductase NrfD  30.51 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1494  respiratory nitrite reductase specific menaquinol--cytochrome-c reductase complex subunit NrfD  26.43 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0589179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3779  polysulphide reductase, NrfD  30.51 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3175  polysulfide reductase, subunit C  28.68 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  44.9 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  30.17 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0242  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.75 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  27.45 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0484  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  23.86 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0606  polysulphide reductase, NrfD  30.11 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>