More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_A0020 on replicon NC_011148
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011148  SeAg_A0020  topoisomerase  100 
 
 		 726 aa  1504    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0087  DNA topoisomerase III  40.43 
 
 		 717 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.451504 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0022  DNA topoisomerase III  40 
 
 		 718 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270283  normal  0.995092 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0003  DNA topoisomerase 3  40.43 
 
 		 717 aa  482  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000970275  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0121  DNA topoisomerase 3  39.7 
 
 		 733 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.488261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0045  DNA topoisomerase III  38.05 
 
 		 730 aa  398  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0221365  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a026  DNA topoisomerase III TraE  38.51 
 
 		 676 aa  385  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0164  DNA topoisomerase 3 (DNA topoisomerase III)  36.67 
 
 		 716 aa  355  1e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000863773  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03041  DNA topoisomerase III  33.54 
 
 		 654 aa  342  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002917  DNA topoisomerase III  33.12 
 
 		 655 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2299  DNA topoisomerase III  33.18 
 
 		 670 aa  336  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0776  DNA topoisomerase III  32.77 
 
 		 645 aa  333  6e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000730539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3275  DNA topoisomerase III  33.86 
 
 		 670 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287374  normal  0.133974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3061  DNA topoisomerase III  33.28 
 
 		 702 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1433  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 		 706 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1498  DNA topoisomerase III  32.98 
 
 		 732 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1630  DNA topoisomerase III  32.01 
 
 		 647 aa  327  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000168302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1486  DNA topoisomerase III  33.08 
 
 		 704 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.892881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1623  DNA topoisomerase III  32.72 
 
 		 705 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.730482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2736  DNA topoisomerase III  32.87 
 
 		 705 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2435  DNA topoisomerase III  32.48 
 
 		 708 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2753  DNA topoisomerase III  32.57 
 
 		 705 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1625  DNA topoisomerase III  32.29 
 
 		 672 aa  321  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08201  DNA topoisomerase III  31.9 
 
 		 734 aa  320  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2830  DNA topoisomerase III  32.41 
 
 		 705 aa  320  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0290514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1658  DNA topoisomerase III  32.38 
 
 		 679 aa  319  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2145  DNA topoisomerase III  33.07 
 
 		 694 aa  317  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.393649  normal  0.847419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2155  DNA topoisomerase III  32.51 
 
 		 647 aa  315  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2976  DNA topoisomerase III  32.47 
 
 		 666 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.930481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1684  DNA topoisomerase III  32.11 
 
 		 634 aa  313  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1966  DNA topoisomerase III  31.25 
 
 		 640 aa  313  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1986  DNA topoisomerase III  32.55 
 
 		 653 aa  313  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1401  DNA topoisomerase III  32.83 
 
 		 653 aa  313  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3001  DNA topoisomerase III  32.67 
 
 		 655 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514044  normal  0.966259 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01732  DNA topoisomerase III  32.39 
 
 		 653 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00246982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1879  DNA topoisomerase III  32.39 
 
 		 653 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000411002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1869  DNA topoisomerase III  32.39 
 
 		 653 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000214138  decreased coverage  0.00000617518 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1847  DNA topoisomerase III  32.39 
 
 		 653 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000137821  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01720  hypothetical protein  32.39 
 
 		 653 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00317357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2018  DNA topoisomerase III  32.39 
 
 		 653 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000256516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1972  DNA topoisomerase III  31.59 
 
 		 641 aa  310  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1428  DNA topoisomerase III  32.39 
 
 		 651 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0037378  normal  0.804884 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1877  DNA topoisomerase III  32.13 
 
 		 649 aa  308  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000540839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2483  DNA topoisomerase III  32.66 
 
 		 653 aa  308  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000298229  normal  0.566589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2268  DNA topoisomerase III  31.19 
 
 		 641 aa  306  8.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1425  DNA topoisomerase III  31.92 
 
 		 649 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.864642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1409  DNA topoisomerase III  31.97 
 
 		 649 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0199719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2048  DNA topoisomerase III  31.97 
 
 		 649 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.177023  normal  0.939846 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2718  DNA topoisomerase III  31.03 
 
 		 641 aa  304  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94815  hitchhiker  0.00169428 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1392  DNA topoisomerase III  31.92 
 
 		 649 aa  305  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.213648  normal  0.301409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27190  DNA topoisomerase III  33.39 
 
 		 650 aa  303  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1310  DNA topoisomerase III  31.97 
 
 		 632 aa  303  8.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00570993  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1612  DNA topoisomerase III  30.83 
 
 		 680 aa  302  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3364  DNA topoisomerase III  33.87 
 
 		 647 aa  301  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2208  DNA topoisomerase III  31.48 
 
 		 641 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.948709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1814  DNA topoisomerase III  33.17 
 
 		 653 aa  300  8e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230615  normal  0.182925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4019  DNA topoisomerase III  33.01 
 
 		 653 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0063  DNA topoisomerase III  29.74 
 
 		 730 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3624  DNA topoisomerase III  32.64 
 
 		 652 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203006  normal  0.930533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1542  DNA topoisomerase III  31.51 
 
 		 645 aa  296  8e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2529  DNA topoisomerase III  30.35 
 
 		 722 aa  296  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2478  DNA topoisomerase III  32.96 
 
 		 662 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2088  DNA topoisomerase III  30.2 
 
 		 642 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00112487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1979  DNA topoisomerase III  30.2 
 
 		 641 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000598454  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2343  DNA topoisomerase III  30.2 
 
 		 641 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000133374  normal  0.0757376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3423  DNA topoisomerase III  33.17 
 
 		 654 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1473  DNA topoisomerase III  32.17 
 
 		 673 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2244  DNA topoisomerase III  32.33 
 
 		 656 aa  293  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275193  normal  0.433607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2298  DNA topoisomerase III  32.64 
 
 		 676 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000135741  hitchhiker  0.000195203 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0974  DNA topoisomerase III  30.81 
 
 		 799 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3385  DNA topoisomerase III  32.64 
 
 		 676 aa  291  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191763  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2823  DNA topoisomerase III  31.64 
 
 		 671 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2400  DNA topoisomerase III  30.32 
 
 		 668 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0990  DNA topoisomerase III  32.22 
 
 		 671 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.585612  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4169  DNA topoisomerase type IA central domain protein  33.44 
 
 		 764 aa  287  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1657  DNA topoisomerase III  31.17 
 
 		 666 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4792  DNA topoisomerase III  30.98 
 
 		 649 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2233  DNA topoisomerase III  32.01 
 
 		 671 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0145948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2461  DNA topoisomerase III  31.62 
 
 		 643 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.42133  normal  0.125855 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  31.35 
 
 		 670 aa  283  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2146  DNA topoisomerase III  29.03 
 
 		 654 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.232139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0752  DNA topoisomerase III  29.41 
 
 		 701 aa  283  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2541  DNA topoisomerase III  30.03 
 
 		 744 aa  280  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.111653  normal  0.0440835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2342  DNA topoisomerase III  30.83 
 
 		 671 aa  280  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1445  DNA topoisomerase III  31.73 
 
 		 670 aa  279  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2923  DNA topoisomerase III  31.3 
 
 		 654 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1311  DNA topoisomerase III  31.73 
 
 		 670 aa  278  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617817  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2624  DNA topoisomerase III  27.71 
 
 		 718 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4319  DNA topoisomerase III  28.64 
 
 		 687 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.535821  normal  0.574882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4150  DNA topoisomerase III  31.09 
 
 		 670 aa  274  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0356061  normal  0.0728569 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6523  DNA topoisomerase III  29.12 
 
 		 687 aa  273  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.728561  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6614  DNA topoisomerase III  29.12 
 
 		 687 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1223  DNA topoisomerase III  31.09 
 
 		 670 aa  273  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4425  DNA topoisomerase III  30.09 
 
 		 707 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.669794  normal  0.110888 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1737  DNA topoisomerase III  29.79 
 
 		 676 aa  270  5e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1853  DNA topoisomerase III  29.84 
 
 		 695 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.989434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0558  DNA topoisomerase III  30.71 
 
 		 680 aa  269  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3295  DNA topoisomerase III  30.73 
 
 		 655 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1767  DNA topoisomerase III  28.8 
 
 		 714 aa  266  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.181202  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0283  DNA topoisomerase III  31.18 
 
 		 684 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>