48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0209 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0209  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 311 aa  609  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2758  tetratricopeptide domain-containing protein  42.41 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  28.33 
 
 		 614 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 591 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3379  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 284 aa  49.7  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.26 
 
 		 784 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 927 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 523 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 713 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.77 
 
 		 784 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.23 
 
 		 906 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 543 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1276 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 1069 aa  46.2  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.53 
 
 		 576 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  28.36 
 
 		 672 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  31.54 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.77 
 
 		 929 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  23.95 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 740 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 1038 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.49 
 
 		 1694 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1421 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 		 836 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 562 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.08 
 
 		 1056 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.77 
 
 		 409 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.52 
 
 		 629 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 		 632 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 204 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.47 
 
 		 739 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.49 
 
 		 795 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 620 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.27 
 
 		 561 aa  42.7  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.74 
 
 		 512 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 211 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5712  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 396 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 935 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 627 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.74 
 
 		 818 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  25.98 
 
 		 174 aa  42.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 699 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 3035 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>