19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2758 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2758  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  481  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0209  tetratricopeptide TPR_4  41.4 
 
 		 311 aa  115  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3379  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1603  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.14 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0684116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1931  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  30.14 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0417979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 594 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 931 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.44 
 
 		 462 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 252 aa  45.4  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.7 
 
 		 539 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3497  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  37.63 
 
 		 530 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 2262 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 361 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2293  tetratricopeptide TPR_2  34.62 
 
 		 384 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 592 aa  42.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>