150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0736 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0736  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 143 aa  280  7.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.85 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  33.85 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  31.75 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  36.59 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1201  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1943  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  33.07 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2300  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  30.65 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.562465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0812  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.91 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.76 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0912  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.3 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0769  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  31.3 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  27.13 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.08 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  29.51 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.12 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  28.68 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  28.69 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.45 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  28.69 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  28.57 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  27.27 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0707  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.28 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.83 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 		 217 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  25.19 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.58 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231311  normal  0.0225242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2346  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.33 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0853163  normal  0.0509628 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.58 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.14 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  27.91 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.23 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  27.91 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  27.91 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  26.45 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2301  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.69 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.58 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.12 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.58 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  26.98 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  29.46 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  29.31 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.03 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.2 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0898  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.53 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.87 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.22 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2860  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.89 
 
 		 226 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070189  hitchhiker  0.000343254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3261  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.89 
 
 		 226 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.98 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1400  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.92 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.377979  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4593  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.12 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 		 218 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.41 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0652382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  25.98 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  24.44 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.47 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.41 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  27.01 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  27.01 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  27.74 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  27.01 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.78 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  28.47 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.76 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.15 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  27.01 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  27.01 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  27.01 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  27.01 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.77 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  27.01 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  27.01 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  23.7 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>