122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0601 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0601  isopentenyl pyrophosphate isomerase  100 
 
 
335 aa  693    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1323  isopentenyl pyrophosphate isomerase  67.07 
 
 
331 aa  476  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.911087  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1937  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.9 
 
 
349 aa  270  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0009  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  42.04 
 
 
312 aa  266  4e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2370  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.77 
 
 
349 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2416  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.77 
 
 
349 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0912  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.06 
 
 
348 aa  226  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000613252  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  37.95 
 
 
779 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2168  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.92 
 
 
349 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000231515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1422  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.09 
 
 
349 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1662  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.78 
 
 
349 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1626  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.47 
 
 
349 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00141431  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3790  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.17 
 
 
349 aa  206  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000935889  hitchhiker  0.000920358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1409  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.78 
 
 
349 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.012496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1520  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.78 
 
 
349 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00602157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1593  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.78 
 
 
349 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66387e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.47 
 
 
349 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0161637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1380  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.17 
 
 
349 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1554  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.86 
 
 
349 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0367947  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0457  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.71 
 
 
349 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1036  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.42 
 
 
341 aa  202  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00681507  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0190  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.54 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1222  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.28 
 
 
349 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.050078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.94 
 
 
350 aa  192  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.345758  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1328  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.42 
 
 
346 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294191  normal  0.034708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.17 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.994842  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1388  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.5 
 
 
350 aa  179  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1718  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.69 
 
 
343 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4134  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.33 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1103  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.31 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.107525  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4596  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.22 
 
 
353 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0726118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1341  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.59 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.920546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4607  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.77 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20655 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  31.25 
 
 
337 aa  163  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114214  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.99 
 
 
341 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4020  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.99 
 
 
341 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2447  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  33.04 
 
 
362 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0414  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.56 
 
 
357 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2029  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.32 
 
 
342 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3410  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  30.32 
 
 
354 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267786  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2461  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.14 
 
 
350 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.664449  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2888  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.41 
 
 
363 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343951  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0435  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.12 
 
 
346 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.949256  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2034  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.4 
 
 
342 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0683  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.77 
 
 
355 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0316  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.84 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0397  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase type 2  31.31 
 
 
340 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000393219  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1947  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  28.49 
 
 
372 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2176  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.57 
 
 
342 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456875  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2211  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.43 
 
 
359 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1145  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.73 
 
 
374 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.473323  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0231  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.73 
 
 
377 aa  150  3e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4687  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.86 
 
 
344 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0843845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2215  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.31 
 
 
345 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1093  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.53 
 
 
354 aa  149  7e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1933  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.63 
 
 
348 aa  149  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1814  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.66 
 
 
350 aa  149  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase FMN-dependent  33.33 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.82 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000033801  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1589  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.45 
 
 
345 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.5 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4187  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.56 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2136  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.57 
 
 
366 aa  145  8.000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.163315  decreased coverage  0.00000969261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0384  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.29 
 
 
357 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.333421  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0417  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.21 
 
 
357 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.059028 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0051  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.29 
 
 
352 aa  144  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1495  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  31.9 
 
 
338 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00576916  hitchhiker  0.000359975 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0272  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.59 
 
 
361 aa  142  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1445  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.36 
 
 
357 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2397  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.56 
 
 
362 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000041762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0400  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.86 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000319511  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3586  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.93 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04924  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.31 
 
 
339 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  28.33 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.916962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1764  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.99 
 
 
361 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1954  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.69 
 
 
348 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2000  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.69 
 
 
348 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1934  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.69 
 
 
348 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154775  normal  0.926283 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0704  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.34 
 
 
359 aa  139  7e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0017  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.75 
 
 
352 aa  138  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4151  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  29.94 
 
 
360 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2437  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.61 
 
 
345 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.0183837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0385  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.07 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4082  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.12 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.242984 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0048  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.42 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0360256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2374  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.43 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0906  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.94 
 
 
355 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1040  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.32 
 
 
355 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.79 
 
 
355 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.326404  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1419  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.86 
 
 
365 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.501382  hitchhiker  0.00657817 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1184  isopentenyl pyrophosphate isomerase  26.83 
 
 
356 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.26 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2044  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  26.98 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80729  cytochrome b2, mitochondrial precursor  24.84 
 
 
581 aa  59.3  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03150  L-mandelate dehydrogenase, putative  25.19 
 
 
555 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.535636  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53263  cytochrome b2, mitochondrial precursor  25.14 
 
 
490 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.792612 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07984  conserved hypothetical protein  30.14 
 
 
503 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11632 
 
 
-
 
NC_006686  CND03480  conserved hypothetical protein  27.73 
 
 
552 aa  53.1  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03901  mitochondrial cytochrome b2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03120)  27.56 
 
 
500 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  23.1 
 
 
437 aa  49.3  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>