93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4134 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4134  isopentenyl pyrophosphate isomerase  100 
 
 		 343 aa  663    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04924  isopentenyl pyrophosphate isomerase  54.55 
 
 		 339 aa  358  7e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase FMN-dependent  55.45 
 
 		 339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4687  isopentenyl pyrophosphate isomerase  52.03 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0843845  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.92 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4020  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.92 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1589  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.9 
 
 		 345 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0435  isopentenyl pyrophosphate isomerase  53.59 
 
 		 346 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.949256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1933  isopentenyl pyrophosphate isomerase  51.64 
 
 		 348 aa  307  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4596  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  47.72 
 
 		 353 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0726118  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4607  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.42 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2461  isopentenyl pyrophosphate isomerase  49.24 
 
 		 350 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.664449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2044  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  48.82 
 
 		 349 aa  299  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2215  isopentenyl pyrophosphate isomerase  51.9 
 
 		 345 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3586  isopentenyl pyrophosphate isomerase  49.09 
 
 		 347 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2437  isopentenyl pyrophosphate isomerase  51.9 
 
 		 345 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.0183837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0400  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.92 
 
 		 351 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000319511  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0397  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase type 2  47.5 
 
 		 340 aa  272  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000393219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4187  isopentenyl pyrophosphate isomerase  45.9 
 
 		 342 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2176  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.97 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.99 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000033801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1954  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.59 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1934  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.59 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154775  normal  0.926283 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2000  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.59 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0316  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.79 
 
 		 360 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1814  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.35 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1718  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.84 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1419  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.53 
 
 		 365 aa  240  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.501382  hitchhiker  0.00657817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1495  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  43.75 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00576916  hitchhiker  0.000359975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0414  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.23 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2397  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.17 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000041762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2211  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.29 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2029  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.64 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0683  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.82 
 
 		 355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  37.54 
 
 		 368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.916962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2034  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.35 
 
 		 342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1764  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.1 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0272  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.48 
 
 		 361 aa  232  6e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2168  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.11 
 
 		 349 aa  232  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000231515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2374  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.05 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1947  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  45.81 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2136  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.8 
 
 		 366 aa  230  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.163315  decreased coverage  0.00000969261 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4151  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  44.81 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2888  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.44 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0417  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.25 
 
 		 357 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.059028 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1093  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.42 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.84 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1445  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.59 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3790  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.32 
 
 		 349 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000935889  hitchhiker  0.000920358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1409  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.02 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.012496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1520  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.02 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00602157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1593  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.02 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66387e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1626  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.62 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00141431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4082  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.69 
 
 		 350 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1554  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.43 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0367947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1662  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.02 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1380  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.02 
 
 		 349 aa  215  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558414  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0051  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.3 
 
 		 352 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1422  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.72 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.72 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0161637  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0017  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.31 
 
 		 352 aa  212  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1222  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.72 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.050078  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0231  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.58 
 
 		 377 aa  209  8e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1145  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.29 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.473323  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0385  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.26 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0384  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.71 
 
 		 357 aa  205  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.333421  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1040  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.19 
 
 		 355 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.19 
 
 		 355 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.326404  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0048  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.71 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0360256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0190  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.14 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0906  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.48 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3410  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  40.8 
 
 		 354 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267786  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  38.21 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114214  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1328  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.28 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294191  normal  0.034708 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.16 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1341  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.67 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.920546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.72 
 
 		 352 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.994842  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1184  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.02 
 
 		 356 aa  189  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0704  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.63 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0457  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.93 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1937  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.94 
 
 		 349 aa  182  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.63 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.345758  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2416  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.32 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2370  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.32 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1388  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.58 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  36.5 
 
 		 779 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1323  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.42 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.911087  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0601  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.33 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2447  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  36.28 
 
 		 362 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0912  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.88 
 
 		 348 aa  155  8e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000613252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1036  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.49 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00681507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1103  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.18 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.107525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0009  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  24.92 
 
 		 312 aa  129  6e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>