98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1328 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1328  isopentenyl pyrophosphate isomerase  100 
 
 
346 aa  687    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294191  normal  0.034708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2168  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.9 
 
 
349 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000231515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1662  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.21 
 
 
349 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1409  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.51 
 
 
349 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.012496  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.51 
 
 
349 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0161637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1380  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.81 
 
 
349 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558414  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1520  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.51 
 
 
349 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00602157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1593  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.51 
 
 
349 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66387e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3790  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.21 
 
 
349 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000935889  hitchhiker  0.000920358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1554  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.92 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0367947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1222  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.54 
 
 
349 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.050078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1626  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.51 
 
 
349 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00141431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1422  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.92 
 
 
349 aa  285  8e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.93 
 
 
352 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.994842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.84 
 
 
350 aa  269  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.345758  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1341  isopentenyl pyrophosphate isomerase  49.01 
 
 
310 aa  268  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.920546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2447  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  46.63 
 
 
362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2416  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.01 
 
 
349 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2370  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.01 
 
 
349 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  44.11 
 
 
779 aa  260  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1937  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.76 
 
 
349 aa  256  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0912  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.7 
 
 
348 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000613252  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0457  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.59 
 
 
349 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2211  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.62 
 
 
359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1947  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  40.86 
 
 
372 aa  232  9e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1388  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.82 
 
 
350 aa  231  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2888  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.11 
 
 
363 aa  229  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343951  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0272  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.4 
 
 
361 aa  228  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0190  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.12 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2136  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.66 
 
 
366 aa  225  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.163315  decreased coverage  0.00000969261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0384  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.71 
 
 
357 aa  224  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.333421  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0316  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.02 
 
 
360 aa  223  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2397  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.86 
 
 
362 aa  223  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000041762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0414  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.98 
 
 
357 aa  220  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0385  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.07 
 
 
363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1036  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.63 
 
 
341 aa  219  5e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00681507  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0683  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.65 
 
 
355 aa  219  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  40.11 
 
 
368 aa  219  6e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.916962  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0417  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.94 
 
 
357 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.059028 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1814  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.47 
 
 
350 aa  216  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1764  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.74 
 
 
361 aa  216  5e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1323  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.28 
 
 
331 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.911087  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1419  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.97 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.501382  hitchhiker  0.00657817 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1103  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.82 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.107525  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0051  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.41 
 
 
352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0009  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  37.54 
 
 
312 aa  212  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4134  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.28 
 
 
343 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2374  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.46 
 
 
354 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4020  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.16 
 
 
341 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1093  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.62 
 
 
354 aa  210  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.16 
 
 
341 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.22 
 
 
357 aa  209  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1184  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.22 
 
 
356 aa  208  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0601  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.42 
 
 
335 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4151  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  40.17 
 
 
360 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1445  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.58 
 
 
357 aa  205  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3410  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  40.29 
 
 
354 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267786  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4687  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.47 
 
 
344 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0843845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2461  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.72 
 
 
350 aa  202  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.664449  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0017  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.06 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4607  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.32 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0435  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.91 
 
 
346 aa  198  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.949256  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0048  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.06 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0360256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1589  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.36 
 
 
345 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3586  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.36 
 
 
347 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0906  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.29 
 
 
355 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2215  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.32 
 
 
345 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1933  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.12 
 
 
348 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  35.8 
 
 
337 aa  193  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114214  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1040  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.73 
 
 
355 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.92 
 
 
355 aa  192  8e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.326404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0397  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase type 2  38.97 
 
 
340 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000393219  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.24 
 
 
356 aa  187  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4596  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  38.31 
 
 
353 aa  186  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0726118  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1145  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.57 
 
 
374 aa  186  6e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.473323  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0231  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.86 
 
 
377 aa  185  8e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2437  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.92 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.0183837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1495  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  40.32 
 
 
338 aa  182  8.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00576916  hitchhiker  0.000359975 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2044  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  36.59 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04924  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.87 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0400  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.69 
 
 
351 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000319511  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase FMN-dependent  36.16 
 
 
339 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1718  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.55 
 
 
343 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.5 
 
 
346 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000033801  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0704  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.25 
 
 
359 aa  169  6e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2034  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.94 
 
 
342 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4082  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.42 
 
 
350 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.242984 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2029  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.86 
 
 
342 aa  159  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2000  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.84 
 
 
348 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1934  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.84 
 
 
348 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154775  normal  0.926283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1954  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.84 
 
 
348 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4187  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.95 
 
 
342 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2176  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.89 
 
 
342 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456875  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1980  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.25 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2810  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.83 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2031  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  25.62 
 
 
336 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.268129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2344  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  38.36 
 
 
395 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3487  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.83 
 
 
383 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323095  normal  0.958366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>