94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1388 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1388  isopentenyl pyrophosphate isomerase  100 
 
 		 350 aa  719    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0457  isopentenyl pyrophosphate isomerase  52.94 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1103  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.38 
 
 		 367 aa  285  5.999999999999999e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.107525  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0912  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.38 
 
 		 348 aa  265  8e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000613252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1222  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.16 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.050078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1422  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.83 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1409  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.83 
 
 		 349 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.012496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1520  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.83 
 
 		 349 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00602157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1380  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.12 
 
 		 349 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.53 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0161637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1593  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.53 
 
 		 349 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66387e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1626  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.53 
 
 		 349 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00141431  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3790  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.24 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000935889  hitchhiker  0.000920358 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1937  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.46 
 
 		 349 aa  245  8e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1662  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.95 
 
 		 349 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1554  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.95 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0367947  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  38.55 
 
 		 779 aa  241  9e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2370  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.6 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2416  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.6 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2168  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.05 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000231515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1328  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.82 
 
 		 346 aa  222  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294191  normal  0.034708 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1036  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.1 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00681507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.8 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.345758  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1341  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.73 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.920546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.89 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.994842  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1093  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.99 
 
 		 354 aa  189  4e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0048  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.29 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0360256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1814  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.31 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0190  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.46 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4687  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.26 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0843845  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0601  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.5 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2447  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  34.76 
 
 		 362 aa  179  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4134  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.58 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0051  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.39 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1323  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.46 
 
 		 331 aa  175  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.911087  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0683  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.29 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2211  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.91 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0009  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  33.13 
 
 		 312 aa  169  8e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0017  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.99 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0385  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.77 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0231  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.63 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0272  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.89 
 
 		 361 aa  166  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.73 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4020  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.73 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0414  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.15 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1145  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.33 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.473323  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4596  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  32.21 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0726118  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3586  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.33 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2397  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.63 
 
 		 362 aa  163  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000041762  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1947  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  29.97 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2888  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.08 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2136  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.34 
 
 		 366 aa  162  9e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.163315  decreased coverage  0.00000969261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0384  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.29 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.333421  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0316  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.54 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1589  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.47 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0397  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase type 2  32.36 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000393219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1933  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.35 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  31.52 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.916962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1419  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.11 
 
 		 365 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.501382  hitchhiker  0.00657817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4607  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.91 
 
 		 351 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1764  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.14 
 
 		 361 aa  156  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2215  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.2 
 
 		 345 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4082  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.88 
 
 		 350 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242984 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0417  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.59 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.059028 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4151  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  29 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2374  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.04 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase FMN-dependent  33.78 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04924  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.12 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0435  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.23 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.949256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2461  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.2 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.664449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1445  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.88 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3410  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  29.25 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267786  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.47 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000033801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2437  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.98 
 
 		 345 aa  146  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.0183837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1495  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  32.8 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00576916  hitchhiker  0.000359975 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0400  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.43 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000319511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.78 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.57 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.326404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2176  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.36 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1040  isopentenyl pyrophosphate isomerase  27.52 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0906  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.07 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4187  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.15 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.58 
 
 		 357 aa  132  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1184  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.44 
 
 		 356 aa  132  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1718  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.13 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  31.45 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114214  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2044  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  28.98 
 
 		 349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0704  isopentenyl pyrophosphate isomerase  28.43 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2034  isopentenyl pyrophosphate isomerase  27.06 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2029  isopentenyl pyrophosphate isomerase  26.25 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1954  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.15 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2000  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.15 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1934  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.15 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154775  normal  0.926283 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3514  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  21.3 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>