96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0683 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0683  isopentenyl pyrophosphate isomerase  100 
 
 
355 aa  719    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1814  isopentenyl pyrophosphate isomerase  59.49 
 
 
350 aa  425  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2211  isopentenyl pyrophosphate isomerase  59.94 
 
 
359 aa  420  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2888  isopentenyl pyrophosphate isomerase  56.94 
 
 
363 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343951  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2374  isopentenyl pyrophosphate isomerase  56.61 
 
 
354 aa  393  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1947  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  49.86 
 
 
372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2397  isopentenyl pyrophosphate isomerase  53.59 
 
 
362 aa  334  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000041762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1419  isopentenyl pyrophosphate isomerase  52.99 
 
 
365 aa  331  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.501382  hitchhiker  0.00657817 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4151  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  49.58 
 
 
360 aa  315  7e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.4 
 
 
357 aa  315  9e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1040  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.41 
 
 
355 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0906  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.97 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.83 
 
 
355 aa  272  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.326404  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1589  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.31 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2461  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.68 
 
 
350 aa  269  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.664449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4020  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.05 
 
 
341 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.05 
 
 
341 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4687  isopentenyl pyrophosphate isomerase  45.69 
 
 
344 aa  268  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0843845  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4596  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  42.52 
 
 
353 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0726118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2136  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.83 
 
 
366 aa  262  8e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.163315  decreased coverage  0.00000969261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4607  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.49 
 
 
351 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20655 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.17 
 
 
356 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2215  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.7 
 
 
345 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0231  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.09 
 
 
377 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1145  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.09 
 
 
374 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.473323  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0051  isopentenyl pyrophosphate isomerase  44.87 
 
 
352 aa  257  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3586  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.2 
 
 
347 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1184  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.61 
 
 
356 aa  256  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1093  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.11 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1933  isopentenyl pyrophosphate isomerase  45.7 
 
 
348 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0316  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.12 
 
 
360 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  38.4 
 
 
337 aa  250  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114214  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  37.64 
 
 
368 aa  250  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.916962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0435  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.86 
 
 
346 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.949256  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0017  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.06 
 
 
352 aa  249  6e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2437  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.29 
 
 
345 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.0183837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0385  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40 
 
 
363 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0048  isopentenyl pyrophosphate isomerase  45.29 
 
 
354 aa  246  4e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0360256 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1764  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.47 
 
 
361 aa  243  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1445  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40 
 
 
357 aa  242  6e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0414  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.54 
 
 
357 aa  242  9e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4134  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.82 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0417  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.35 
 
 
357 aa  236  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.059028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0384  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.14 
 
 
357 aa  235  8e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.333421  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3410  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  40.86 
 
 
354 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267786  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase FMN-dependent  41.35 
 
 
339 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2044  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  41.62 
 
 
349 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0397  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase type 2  39.13 
 
 
340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000393219  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04924  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.59 
 
 
339 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1495  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  39.52 
 
 
338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00576916  hitchhiker  0.000359975 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1718  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.06 
 
 
343 aa  219  6e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2168  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.53 
 
 
349 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000231515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1341  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.91 
 
 
310 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.920546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1554  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.87 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0367947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3790  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.58 
 
 
349 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000935889  hitchhiker  0.000920358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1626  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.58 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00141431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1422  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.28 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.37 
 
 
346 aa  213  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000033801  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0190  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.45 
 
 
336 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1380  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.28 
 
 
349 aa  212  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0400  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.59 
 
 
351 aa  212  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000319511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1662  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.98 
 
 
349 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4082  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.06 
 
 
350 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.242984 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.98 
 
 
349 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0161637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1593  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.98 
 
 
349 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66387e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1520  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.98 
 
 
349 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00602157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1409  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.98 
 
 
349 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.012496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2447  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  37.32 
 
 
362 aa  205  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1222  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.2 
 
 
349 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.050078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.78 
 
 
352 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.994842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1328  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.65 
 
 
346 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294191  normal  0.034708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.51 
 
 
350 aa  202  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.345758  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0272  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.18 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2176  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.28 
 
 
342 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456875  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1934  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.72 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154775  normal  0.926283 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2029  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.58 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2000  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.72 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1954  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.72 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4187  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.31 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  37.03 
 
 
779 aa  195  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0704  isopentenyl pyrophosphate isomerase  31.99 
 
 
359 aa  194  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2034  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.73 
 
 
342 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1937  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.84 
 
 
349 aa  185  9e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1036  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.24 
 
 
341 aa  181  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00681507  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2370  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.04 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2416  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.04 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1388  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.29 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0457  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.22 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0912  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.66 
 
 
348 aa  160  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000613252  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0601  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.77 
 
 
335 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1323  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.48 
 
 
331 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.911087  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1103  isopentenyl pyrophosphate isomerase  30.47 
 
 
367 aa  150  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.107525  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0009  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  27.22 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2255  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  24.17 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1864  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) related alpha-hydroxy acid dehydrogenase  28.16 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.213677  hitchhiker  0.000000000554071 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09014  FMN-dependent dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02300)  34.83 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.219396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>