94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000726 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase FMN-dependent  100 
 
 		 339 aa  696    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04924  isopentenyl pyrophosphate isomerase  84.96 
 
 		 339 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4134  isopentenyl pyrophosphate isomerase  55.45 
 
 		 343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0910498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  48.93 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4020  isopentenyl pyrophosphate isomerase  48.93 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4607  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.9 
 
 		 351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3586  isopentenyl pyrophosphate isomerase  48.08 
 
 		 347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4596  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  47.31 
 
 		 353 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0726118  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1589  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.11 
 
 		 345 aa  297  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2461  isopentenyl pyrophosphate isomerase  47.87 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.664449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1933  isopentenyl pyrophosphate isomerase  48.17 
 
 		 348 aa  285  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0435  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.41 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.949256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4687  isopentenyl pyrophosphate isomerase  48.48 
 
 		 344 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0843845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2215  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.25 
 
 		 345 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2044  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  44.14 
 
 		 349 aa  276  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4151  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  48.05 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2437  isopentenyl pyrophosphate isomerase  46.57 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.0183837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1718  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.74 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1947  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  43.9 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0384  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.06 
 
 		 357 aa  246  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.333421  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.81 
 
 		 346 aa  241  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000033801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0417  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.91 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.059028 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0414  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.06 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0400  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.61 
 
 		 351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000319511  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0316  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.88 
 
 		 360 aa  239  4e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2136  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.4 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.163315  decreased coverage  0.00000969261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4187  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.39 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.433559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1814  isopentenyl pyrophosphate isomerase  42.04 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0397  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase type 2  41.93 
 
 		 340 aa  229  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000393219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0683  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.35 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1764  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.02 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2211  isopentenyl pyrophosphate isomerase  43.35 
 
 		 359 aa  228  9e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2176  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.33 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0385  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.48 
 
 		 363 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2888  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.64 
 
 		 363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1495  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  40.98 
 
 		 338 aa  226  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00576916  hitchhiker  0.000359975 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1445  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.53 
 
 		 357 aa  226  6e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.65 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.157311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2374  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.77 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2029  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.51 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1145  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.46 
 
 		 374 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.473323  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2397  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.27 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000041762  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0231  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.46 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2034  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.51 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2000  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.76 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1934  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.76 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154775  normal  0.926283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1954  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.76 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1419  isopentenyl pyrophosphate isomerase  40.41 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.501382  hitchhiker  0.00657817 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1043  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  34.69 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.916962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1040  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.69 
 
 		 355 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0272  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.72 
 
 		 361 aa  212  9e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0906  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.46 
 
 		 355 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.87 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.326404  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0051  isopentenyl pyrophosphate isomerase  41.02 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0726  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  38.69 
 
 		 337 aa  206  7e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2168  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.63 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000231515  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1058  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.58 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1093  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.81 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4082  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.8 
 
 		 350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242984 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1184  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.99 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0017  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.39 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1554  isopentenyl pyrophosphate isomerase  38.23 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0367947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3790  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.26 
 
 		 349 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000935889  hitchhiker  0.000920358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1380  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.54 
 
 		 349 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1626  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.54 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00141431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1409  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.54 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.012496  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1381  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.2 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0161637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1520  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.54 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00602157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1662  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.2 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1593  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.54 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66387e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1422  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.52 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1222  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.35 
 
 		 349 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.050078  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0704  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.67 
 
 		 359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0048  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.05 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0360256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3410  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  40.53 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.267786  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1637  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.55 
 
 		 350 aa  178  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.345758  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0190  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.23 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2447  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  38.49 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0457  isopentenyl pyrophosphate isomerase  35.06 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1937  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.88 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1341  isopentenyl pyrophosphate isomerase  39.92 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.920546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0474  isopentenyl pyrophosphate isomerase  37.28 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.994842  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1036  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.93 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00681507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1328  isopentenyl pyrophosphate isomerase  36.16 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294191  normal  0.034708 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1388  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.78 
 
 		 350 aa  152  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2416  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.36 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2370  isopentenyl pyrophosphate isomerase  32.36 
 
 		 349 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1323  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.46 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.911087  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0601  isopentenyl pyrophosphate isomerase  33.33 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1103  isopentenyl pyrophosphate isomerase  29.86 
 
 		 367 aa  145  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.107525  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  32.57 
 
 		 779 aa  135  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0912  isopentenyl pyrophosphate isomerase  34.01 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000613252  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0009  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  26.75 
 
 		 312 aa  113  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17300  glutamate synthase (NADPH) large subunit  27.07 
 
 		 437 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>