More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2061 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2061  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2531  MerR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00201177  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2583  regulatory protein MerR  43.88 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 160 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 395 aa  75.5  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  28.07 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  37 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  26.92 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  30.83 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  32.32 
 
 		 157 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  24.56 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  48.48 
 
 		 129 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  36.62 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  39.44 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  20.19 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  39.71 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  29.11 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.63 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  36 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  37 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  24.37 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  29.29 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  23.08 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  36.11 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  29.29 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.63 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 107 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.63 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  36.23 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  38.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  30.48 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  38.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  38.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  38.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0280  putative transcription regulator protein  29.73 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0843024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1311  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.852377  normal  0.0692282 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  38.1 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1354  regulatory protein, MerR  27.27 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  38.1 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  38.1 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5291  transcriptional regulator, MerR family  28.3 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  32.35 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  31.17 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  32.56 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  38.1 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  38.1 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  33.71 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  31.87 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0133  MerR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 151 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 143 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.82 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  30.59 
 
 		 131 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 134 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  32.35 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>