More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2583 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2583  regulatory protein MerR  100 
 
 		 254 aa  531  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2531  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  531  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00201177  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2061  MerR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 238 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 241 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 160 aa  88.2  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  28.18 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  43.68 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  26.81 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  42.53 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  42.53 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  42.53 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  34.29 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  31.45 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  34.29 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  34.29 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  27.97 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  31.45 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  44.78 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  29.31 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  29.31 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  29.31 
 
 		 132 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  26.83 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  41.79 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  28.16 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  28.57 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  30.61 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1311  MerR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3003  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.101668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  32.03 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  41.79 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  28.95 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 191 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  29.59 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  29.13 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  41.79 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  41.79 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1817  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  33.94 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2244  regulatory protein, MerR  32.48 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  45.31 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  35.71 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4022  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.605309  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3541  MerR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3099  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00609185  decreased coverage  0.00847969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1363  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  41.79 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  41.79 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 135 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1604  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2845  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 152 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  40.3 
 
 		 158 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1994  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 135 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1720  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  33.68 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  31.86 
 
 		 136 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02411  Transcriptional regulator, MerR family protein  29.82 
 
 		 151 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1615  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 145 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116255  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4372  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 137 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  22.54 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>