More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1951 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1951  formyl transferase-like protein  100 
 
 		 265 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.311505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2463  formyl transferase domain protein  36.8 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2469  formyl transferase domain protein  30.81 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.351452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1784  formyl transferase domain protein  32.12 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2584  hypothetical protein  32.43 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 		 309 aa  72  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  38.52 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0945  formyl transferase domain-containing protein  40.16 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777167  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0915  hypothetical protein  30.77 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 359 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  32.79 
 
 		 312 aa  68.6  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3177  formyl transferase domain-containing protein  32 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1943  formyl transferase domain protein  33.47 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  31.97 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  32.39 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0319  formyl transferase domain-containing protein  31.95 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  32.52 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0745  methionyl-tRNA formyltransferase  37.37 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.491036  hitchhiker  0.00000000582553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2763  formyl transferase domain protein  31.89 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  31.4 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3634  putative formyltransferase  32.54 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.374471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1386  methionyl-tRNA formyltransferase  31.15 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  32.09 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  31.4 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  33.62 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0415  methionyl-tRNA formyltransferase  30.12 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.467918  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02540  methionyl-tRNA formyltransferase  37.61 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0264406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2439  formyl transferase domain-containing protein  28.97 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0438  putative formyltransferase  31.3 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.273297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  31.45 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  30.7 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  36 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  33.04 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  31.4 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  31.4 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  27.34 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3690  formyl transferase domain protein  35.85 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  27.34 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  34.4 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  34.45 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13431  hypothetical protein  26.4 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2540  formyl transferase domain-containing protein  30.97 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.05523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  33.06 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  32.76 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  35.29 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0383  methionyl-tRNA formyltransferase  21.71 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  28.06 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0432  putative formyltransferase  32.17 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1515  formyltransferase, putative  29.59 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138286  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  32.8 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  33.1 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  36.73 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  35.92 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  28.26 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  29.27 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0393  methionyl-tRNA formyltransferase  32.17 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.894516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  31.45 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  29.84 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1161  formyl transferase domain protein  26.6 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  28.23 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3697  putative formyltransferase  33.33 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0659  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.53 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.48364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  30.17 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3464  fused UDP-L-Ara4N formyltransferase ; UDP-GlcA C- 4'-decarboxylase  32.58 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  hitchhiker  0.00203442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2025  Formyl transferase-like  28.46 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.45542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0691  formyl transferase domain-containing protein  28.87 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  31.71 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2468  formyl transferase domain protein  30.83 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0908762 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  30.07 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  28.06 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  34.38 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1673  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.04 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0568966 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  35.82 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  28.47 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  28.97 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  33.54 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  33.61 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  30.15 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  32.54 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  34.43 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0392  formyl transferase domain protein  28.06 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  27.59 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  32.28 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  31.75 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  31.67 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43843  predicted protein  35.96 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2980  putative formyltransferase  33.63 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  27.01 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  31.58 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  29.37 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  30.85 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  29.82 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1833  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  32 
 
 		 667 aa  55.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07800  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  40 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.463663  normal  0.355884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1727  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  32 
 
 		 667 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>