More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43843 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009374  OSTLU_43843  predicted protein  100 
 
 		 386 aa  769    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14917  predicted protein  42.52 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  38.18 
 
 		 314 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  35.78 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  34.86 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 		 319 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  31.21 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  38.7 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  34.57 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  37.12 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  36.61 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  35.6 
 
 		 318 aa  167  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  35.17 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  34.06 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  37.12 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  35.37 
 
 		 315 aa  166  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  34.66 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  36.22 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  34.67 
 
 		 318 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3920  methionyl-tRNA formyltransferase  37.05 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  34.98 
 
 		 318 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  35.91 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  35.69 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  33.74 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  36.22 
 
 		 310 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  35.91 
 
 		 318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  31.83 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  36.22 
 
 		 310 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  35.58 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  34.45 
 
 		 315 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  34.98 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  35.91 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  37.04 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  35.38 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  35.38 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  30.61 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  30.61 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  35.38 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  34.67 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  35.38 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  35.6 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  35.15 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  35.91 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  35.6 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  35.6 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  34.45 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  36.67 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  34.26 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  34.77 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  33.75 
 
 		 321 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  34.56 
 
 		 316 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  31.94 
 
 		 318 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  34.37 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 315 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  35.19 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  35.19 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  35.49 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  34.05 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  35.19 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  35.19 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  35.19 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  34.36 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 		 309 aa  158  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  35.47 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  34.12 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  30.03 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  41.94 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  33.13 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  34.77 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  35.08 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  34.37 
 
 		 324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  33.83 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  34.67 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 		 315 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  34.06 
 
 		 319 aa  156  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  33.85 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  34.97 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  34.26 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  38.8 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  35.49 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  31.9 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  36.39 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  34.88 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  34.26 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  34.53 
 
 		 369 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 		 314 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  40.18 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  32.93 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  33.13 
 
 		 314 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>