More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1514 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
321 aa  655    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  49.04 
 
 
316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  51.6 
 
 
311 aa  324  1e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1172  methionyl-tRNA formyltransferase  57.96 
 
 
317 aa  318  7.999999999999999e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  51.89 
 
 
323 aa  310  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  51.13 
 
 
314 aa  308  9e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  52.46 
 
 
305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  47.91 
 
 
318 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  48.23 
 
 
314 aa  293  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 
314 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 
314 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 
314 aa  289  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 
314 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 
314 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  49.01 
 
 
314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  48.33 
 
 
314 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  49.01 
 
 
314 aa  288  7e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  48.33 
 
 
314 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  47.74 
 
 
311 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  47.74 
 
 
311 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  48.6 
 
 
319 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  44.59 
 
 
310 aa  265  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  44.81 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 
310 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 
313 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  44.44 
 
 
255 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  38.13 
 
 
315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 
314 aa  215  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 
314 aa  215  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  37.87 
 
 
359 aa  215  8e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 
315 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 
315 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  37.67 
 
 
313 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  38.16 
 
 
310 aa  209  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  37.09 
 
 
314 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  36.75 
 
 
315 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  37.74 
 
 
309 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  38.34 
 
 
311 aa  206  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0520  methionyl-tRNA formyltransferase  37.14 
 
 
317 aa  205  9e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 
319 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  37.67 
 
 
318 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  34.52 
 
 
311 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  35.9 
 
 
315 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 
318 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
315 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  37.1 
 
 
309 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 
315 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 
315 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 
315 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  36.09 
 
 
315 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  35.46 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  36.31 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  35.26 
 
 
315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 
311 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  35.64 
 
 
313 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  35.12 
 
 
315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 
311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  37.75 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  33.96 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  34.95 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  37.2 
 
 
312 aa  196  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  33.65 
 
 
318 aa  195  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  35.33 
 
 
327 aa  195  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 
329 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  35.41 
 
 
318 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2272  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 
320 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  36.6 
 
 
316 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 
315 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  34.5 
 
 
315 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  36.54 
 
 
313 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  35.08 
 
 
318 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  34.66 
 
 
332 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  33.65 
 
 
318 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  33.65 
 
 
318 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  34.74 
 
 
321 aa  192  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  33.66 
 
 
318 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  35.08 
 
 
318 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  34.75 
 
 
318 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  37.68 
 
 
334 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 
318 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 
308 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  36.13 
 
 
316 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  36.96 
 
 
312 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  34.37 
 
 
333 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  34.19 
 
 
317 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  34.52 
 
 
309 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  35.08 
 
 
315 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  33.98 
 
 
312 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
312 aa  185  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>