More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0316 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  73.77 
 
 		 305 aa  484  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  66.25 
 
 		 323 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  52.72 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  52.72 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  54.25 
 
 		 310 aa  329  4e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  51.6 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 314 aa  320  3e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  47.94 
 
 		 318 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  47.88 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  47.78 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 		 314 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  47.3 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  47.15 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  47.15 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  47.94 
 
 		 319 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1172  methionyl-tRNA formyltransferase  50.83 
 
 		 317 aa  281  7.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  43.09 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  42.76 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.57 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  42.17 
 
 		 310 aa  248  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 		 318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0520  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  41.75 
 
 		 316 aa  242  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  42.86 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 		 311 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  43.19 
 
 		 317 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  39.55 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  38.12 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  42.47 
 
 		 359 aa  235  8e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  41 
 
 		 311 aa  235  9e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  42.09 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.19 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  39.35 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  39.73 
 
 		 318 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  37.74 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  39.14 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  39.06 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  37.86 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  39.32 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40.6 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  39.68 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.27 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 		 315 aa  225  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  40.47 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  39.75 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  43.87 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  37.26 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  41.72 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  42.19 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  37.21 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  38.98 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  36.98 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  35.81 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  35.81 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  38.11 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 311 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  39.26 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  39.26 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  39.26 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  39.26 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  39.26 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  35.81 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  35.69 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  37.92 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 		 329 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 329 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 		 320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  37.1 
 
 		 308 aa  215  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>