More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1395 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 305 aa  622  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  73.77 
 
 		 311 aa  484  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  65.61 
 
 		 323 aa  426  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  56.48 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  56.48 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  53.29 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  52.61 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  49.51 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  52.46 
 
 		 321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  47.08 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  45.31 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1172  methionyl-tRNA formyltransferase  48.54 
 
 		 317 aa  265  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  44.01 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 314 aa  261  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  43.37 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  46.93 
 
 		 319 aa  258  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  43.2 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  43.55 
 
 		 314 aa  245  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 		 310 aa  245  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0520  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  41.55 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  41.55 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  41.55 
 
 		 318 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.55 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  41.39 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  41.55 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  40.63 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  41.16 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.54 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  39.54 
 
 		 320 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  42.52 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  40.54 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  40.89 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 		 321 aa  228  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.86 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  41.98 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  40.55 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  39.34 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  41.89 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  39.66 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  42.09 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  40.59 
 
 		 315 aa  222  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 310 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  39.09 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  39.61 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 		 314 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  39.12 
 
 		 316 aa  218  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  40.72 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  41.3 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  40.94 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  39.46 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  40.96 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  40.96 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  40.96 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  40.96 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40.96 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  40.61 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40.61 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.61 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40.61 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40.61 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40.61 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 		 307 aa  212  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 		 309 aa  211  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  38.02 
 
 		 309 aa  211  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  40.27 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>