More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0520 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0520  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 317 aa  637    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  61.46 
 
 		 313 aa  401  1e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  41.93 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 		 314 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 		 314 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  43.52 
 
 		 314 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  43.52 
 
 		 314 aa  245  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  41.33 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  41.33 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  41.67 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  42.47 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 312 aa  218  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  36.42 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0508  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.2 
 
 		 329 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  35.49 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  35.49 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  35.49 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  41.47 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  36.63 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1514  methionyl-tRNA formyltransferase  37.14 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1172  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 		 317 aa  205  9e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  35.49 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  40.49 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  36.3 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  41.38 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  37.41 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  35.49 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  31.48 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  36.3 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  34 
 
 		 311 aa  201  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf816  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  35.15 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  35.15 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  34 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  35.27 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  35.12 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  34.11 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  34.65 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  35.31 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  32.57 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  36.18 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  34.2 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  35.55 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  36.18 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  35.53 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 		 317 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  35.55 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  41.74 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  35.39 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  36.63 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  32.33 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  34.58 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  35.97 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.06 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  35.12 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  33.77 
 
 		 314 aa  192  9e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  34.55 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  33.76 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  33.44 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  34.47 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  33.99 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  32.01 
 
 		 359 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  35.22 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  30.82 
 
 		 314 aa  188  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  36.84 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  33.67 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  30.36 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  33.67 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  30.33 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  30.33 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>