More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf816 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf816  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0520  methionyl-tRNA formyltransferase  37.71 
 
 
317 aa  201  9e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  37.41 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  38.19 
 
 
316 aa  192  7e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  36.95 
 
 
314 aa  189  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  41.22 
 
 
313 aa  186  3e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  34.59 
 
 
311 aa  185  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  34.59 
 
 
311 aa  185  9e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  34.46 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  37.75 
 
 
314 aa  178  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 
314 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  36.16 
 
 
314 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  30.69 
 
 
317 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
317 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 
314 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 
314 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 
314 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 
314 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 
314 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 
314 aa  175  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  34.24 
 
 
329 aa  175  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  34.01 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  35.03 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  32.2 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  34.38 
 
 
305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  28.97 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  30.07 
 
 
359 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  32.2 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
311 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  30.3 
 
 
315 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  30.3 
 
 
315 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  31.86 
 
 
309 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  32.2 
 
 
318 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  30.3 
 
 
315 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  31.86 
 
 
318 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  36.61 
 
 
319 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
318 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  31.86 
 
 
312 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  31.38 
 
 
313 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  29.66 
 
 
318 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  29.66 
 
 
318 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
321 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 
315 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 
315 aa  168  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  34.35 
 
 
313 aa  168  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 
315 aa  168  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  32.67 
 
 
315 aa  168  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  32.67 
 
 
315 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  32.65 
 
 
318 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  33.73 
 
 
313 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  32.66 
 
 
315 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  34.55 
 
 
327 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 
312 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  32.53 
 
 
318 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  30.64 
 
 
314 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  34.25 
 
 
318 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  32.31 
 
 
318 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  32.31 
 
 
318 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  31.74 
 
 
311 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  32.33 
 
 
315 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 
315 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  31.62 
 
 
309 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  30.95 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  32 
 
 
315 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  30.69 
 
 
311 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  32.99 
 
 
320 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  32 
 
 
315 aa  166  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  33.45 
 
 
314 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  33.45 
 
 
314 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  30.95 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  32.76 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  32.42 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  31.53 
 
 
318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  31.85 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  32.88 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  31.4 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  32.33 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  37.65 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  31.29 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  30.98 
 
 
315 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  30.82 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  35.41 
 
 
316 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  34.66 
 
 
319 aa  162  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  33.11 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  32.53 
 
 
310 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  31.06 
 
 
314 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  35.48 
 
 
315 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  35.78 
 
 
314 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  30.64 
 
 
315 aa  159  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  37.2 
 
 
332 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  32.54 
 
 
323 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  34.6 
 
 
334 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1172  methionyl-tRNA formyltransferase  33.93 
 
 
317 aa  158  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  32.41 
 
 
315 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  31.19 
 
 
321 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  32.41 
 
 
315 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  32.81 
 
 
315 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  32.41 
 
 
315 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  32.41 
 
 
315 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>