More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2439 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2439  formyl transferase domain-containing protein  100 
 
 
252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2463  formyl transferase domain protein  30.09 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13431  hypothetical protein  30.71 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1784  formyl transferase domain protein  28.95 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2469  formyl transferase domain protein  29.59 
 
 
326 aa  79  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3177  formyl transferase domain-containing protein  25.26 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  26.49 
 
 
333 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2691  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  33.59 
 
 
664 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  33.82 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0972  methionyl-tRNA formyltransferase  29.37 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.319816  normal  0.276171 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  29.56 
 
 
315 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1951  formyl transferase-like protein  29.5 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.311505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  29.25 
 
 
331 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  30.6 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  31.72 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  31.03 
 
 
330 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  32.48 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0036  methionyl-tRNA formyltransferase  29.66 
 
 
327 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  31.71 
 
 
327 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  31.03 
 
 
330 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  31.03 
 
 
327 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  31.03 
 
 
330 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2584  hypothetical protein  28.71 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  27.04 
 
 
320 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  30.97 
 
 
315 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  30.97 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  31.45 
 
 
320 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  26.77 
 
 
315 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  29.73 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  21.03 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  29.93 
 
 
320 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  31.5 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  29.94 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  25.71 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  32.12 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  32.12 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  32.32 
 
 
327 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  32.12 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0915  hypothetical protein  28.95 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11737  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4017  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  32.61 
 
 
660 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2110  methionyl-tRNA formyltransferase  27.73 
 
 
327 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.6282 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  27.56 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  30 
 
 
312 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  31.45 
 
 
321 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  30.61 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4080  methionyl-tRNA formyltransferase  34.31 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  30.61 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  34.48 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1548  methionyl-tRNA formyltransferase  26.5 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3464  fused UDP-L-Ara4N formyltransferase ; UDP-GlcA C- 4'-decarboxylase  33.61 
 
 
315 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  hitchhiker  0.00203442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  30.72 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0090  hypothetical protein  25.77 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  30.34 
 
 
327 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  28.97 
 
 
328 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  28.87 
 
 
344 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  29.92 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  30.37 
 
 
318 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1727  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  29.32 
 
 
667 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2610  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  29.32 
 
 
667 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5162  putative formyltransferase  33.86 
 
 
315 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  27.12 
 
 
312 aa  56.6  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1833  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  29.32 
 
 
667 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  31.06 
 
 
317 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4113  methionyl-tRNA formyltransferase  34.31 
 
 
312 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195925  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  29.3 
 
 
318 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 
312 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  32.12 
 
 
318 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0883  methionyl-tRNA formyltransferase  26.23 
 
 
334 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  31.39 
 
 
318 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1412  putative formyltransferase  33.08 
 
 
315 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  35.65 
 
 
314 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  31.65 
 
 
316 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  26.55 
 
 
315 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1572  methionyl-tRNA formyltransferase  25.64 
 
 
332 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  25.89 
 
 
315 aa  55.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1885  putative formyltransferase  33.57 
 
 
315 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0884  putative formyltransferase  31.93 
 
 
311 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686111  hitchhiker  0.000000271321 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1236  formyltransferase, putative  23.94 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000369668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3948  methionyl-tRNA formyltransferase  31.78 
 
 
334 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  24.88 
 
 
318 aa  55.5  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1799  putative formyltransferase  33.08 
 
 
315 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf816  methionyl-tRNA formyltransferase  25 
 
 
285 aa  55.5  0.0000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  28.28 
 
 
328 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1771  putative formyltransferase  33.08 
 
 
315 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572705  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0053  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.29 
 
 
184 aa  55.5  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.243956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  28.79 
 
 
304 aa  55.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  29.46 
 
 
315 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>