More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0654 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1868  serine-pyruvate aminotransferase  90.93 
 
 		 375 aa  669    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0517  aminotransferase, class V  91.2 
 
 		 375 aa  670    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0654  aminotransferase, class V  100 
 
 		 375 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.360401  normal  0.15732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1395  aminotransferase, class V  75.27 
 
 		 375 aa  578  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2300  aminotransferase, class V  73.73 
 
 		 374 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2393  aminotransferase  72 
 
 		 376 aa  558  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.777426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1241  aminotransferase, class V  69.87 
 
 		 376 aa  539  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3723  aminotransferase, class V  66.4 
 
 		 376 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2112  Serine-pyruvate aminotransferase/ aspartate aminotransferase-like protein  64.29 
 
 		 382 aa  513  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0461  aminotransferase, class V  66.04 
 
 		 386 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2675  aminotransferase, class V  62.93 
 
 		 375 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3621  aminotransferase class V  62.93 
 
 		 375 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0562  serine-pyruvate aminotransferase  63.73 
 
 		 375 aa  495  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3477  aminotransferase, class V  63.2 
 
 		 375 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5870  aminotransferase class V  63.73 
 
 		 375 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6685  putative serine-pyruvate aminotransferase  62.57 
 
 		 375 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4044  aminotransferase class V  62.93 
 
 		 375 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1367  aminotransferase, class V  61.5 
 
 		 382 aa  488  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0177  serine-pyruvate aminotransferase  60.9 
 
 		 378 aa  490  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106999 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3691  aminotransferase, class V  63.47 
 
 		 375 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4174  aminotransferase, class V  63.37 
 
 		 403 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0255  putative serine-pyruvate aminotransferase  64.85 
 
 		 375 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3136  serine-pyruvate transaminase  62.13 
 
 		 377 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1782  aminotransferase class V  61.87 
 
 		 377 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2722  aminotransferase, class V  61.6 
 
 		 376 aa  484  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0163683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4989  aminotransferase class V  62.4 
 
 		 375 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4141  serine-pyruvate aminotransferase  63.2 
 
 		 375 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0190  aminotransferase, class V  60.64 
 
 		 378 aa  482  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4464  aminotransferase, class V  61.87 
 
 		 384 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0422  aminotransferase, class V  62.83 
 
 		 378 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0414  aminotransferase class V  62.83 
 
 		 378 aa  478  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3240  aminotransferase class V  63.37 
 
 		 375 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331017  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0640  aminotransferase, class V  63.37 
 
 		 379 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1074  aminotransferase class V  61.23 
 
 		 380 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49601  alanine glyoxylate aminotransferase  50.51 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000836807  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18704  predicted protein  50.57 
 
 		 359 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.018829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  33.05 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0828  aminotransferase, class V  28.44 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0463  aminotransferase, class V  68.49 
 
 		 88 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.55243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  28.28 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05470  alanine-glyoxylate transaminase, putative  26.78 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  28.69 
 
 		 401 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  23.61 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  23.23 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  23.23 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  27.94 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0406  aminotransferase class V  32.14 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.472989  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  27.55 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  26.06 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  28.49 
 
 		 396 aa  89.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  28.06 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  24.56 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  27.32 
 
 		 382 aa  86.3  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  27.74 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01342  hypothetical alanine--glyoxylate aminotransferase (Eurofung)  23.9 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000773374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  24.73 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  29.79 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  27.54 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  26.29 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  28.98 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  25.66 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  24.29 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  29.31 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  25 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  25.71 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  27.46 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  25.07 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  25.71 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.63 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  26.42 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0967  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  27.17 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00178187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  24.18 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  28.73 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  29.49 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  31.34 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  26.22 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  25.23 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  26.07 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  25 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  25.57 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  24.17 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  25.72 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  27.51 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  26.94 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  27 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  26.01 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  22.78 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  24.72 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  23.85 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  26.01 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  26.01 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  26.25 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  25.56 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  27.51 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  26.01 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  22.49 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  26.05 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5064  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  28.24 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.761871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3219  alanine--glyoxylate aminotransferase  27.7 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000141381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  26.26 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>