More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2722 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2722  aminotransferase, class V  100 
 
 		 376 aa  780    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0163683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4141  serine-pyruvate aminotransferase  74.13 
 
 		 375 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0562  serine-pyruvate aminotransferase  74.67 
 
 		 375 aa  594  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4174  aminotransferase, class V  74.87 
 
 		 403 aa  592  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4989  aminotransferase class V  74.67 
 
 		 375 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5870  aminotransferase class V  74.13 
 
 		 375 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2675  aminotransferase, class V  74.67 
 
 		 375 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0255  putative serine-pyruvate aminotransferase  73.87 
 
 		 375 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4464  aminotransferase, class V  73.6 
 
 		 384 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0461  aminotransferase, class V  73.53 
 
 		 386 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6685  putative serine-pyruvate aminotransferase  73.8 
 
 		 375 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3691  aminotransferase, class V  72.53 
 
 		 375 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4044  aminotransferase class V  72.8 
 
 		 375 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3240  aminotransferase class V  72.99 
 
 		 375 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3621  aminotransferase class V  73.6 
 
 		 375 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3477  aminotransferase, class V  72.27 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1367  aminotransferase, class V  69.79 
 
 		 382 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3723  aminotransferase, class V  69.6 
 
 		 376 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1782  aminotransferase class V  68 
 
 		 377 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3136  serine-pyruvate transaminase  67.02 
 
 		 377 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1074  aminotransferase class V  66.31 
 
 		 380 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0414  aminotransferase class V  66.31 
 
 		 378 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0422  aminotransferase, class V  66.31 
 
 		 378 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2393  aminotransferase  64.63 
 
 		 376 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.777426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0640  aminotransferase, class V  64.71 
 
 		 379 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2300  aminotransferase, class V  61.39 
 
 		 374 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1241  aminotransferase, class V  61.07 
 
 		 376 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2112  Serine-pyruvate aminotransferase/ aspartate aminotransferase-like protein  60.85 
 
 		 382 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0517  aminotransferase, class V  61.6 
 
 		 375 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1868  serine-pyruvate aminotransferase  61.33 
 
 		 375 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0654  aminotransferase, class V  61.6 
 
 		 375 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.360401  normal  0.15732 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0177  serine-pyruvate aminotransferase  58.09 
 
 		 378 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0190  aminotransferase, class V  58.09 
 
 		 378 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1395  aminotransferase, class V  58.13 
 
 		 375 aa  454  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49601  alanine glyoxylate aminotransferase  51.26 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000836807  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18704  predicted protein  53.74 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.018829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0463  aminotransferase, class V  75.34 
 
 		 88 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.55243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  28.97 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0828  aminotransferase, class V  26.99 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0406  aminotransferase class V  29.55 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.472989  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  22.67 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  27.3 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  29.61 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  21.88 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  25.17 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  21.97 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  29.33 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.25 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  21.18 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  25.2 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  22.95 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  24.56 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  23.66 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  24.46 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  21.18 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  21.18 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  23.73 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  25.83 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  28.11 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  25.84 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44075  predicted protein  24.37 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  28.69 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  25.82 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  26.07 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  23.61 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  22.19 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  26.14 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  25.71 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  22.8 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  24.52 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  21.85 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  25.35 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01342  hypothetical alanine--glyoxylate aminotransferase (Eurofung)  24.46 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000773374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  27.27 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  22.82 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  22.82 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  20.73 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  22.69 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  22.16 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  24.29 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  23.28 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  22.44 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  20.25 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  24.36 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  24.76 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0791  aminotransferase class V  24.55 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.644742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  29.06 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  25.35 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  25.28 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2047  alanine--glyoxylate aminotransferase  24.91 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000188057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  25.31 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3219  alanine--glyoxylate aminotransferase  24.91 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000141381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  25.85 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0347  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  27.81 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26402  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  24.15 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3204  aminotransferase, class V  24.91 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3165  aminotransferase, class V  24.91 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00663559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0866  alanine--glyoxylate aminotransferase  24.91 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000382013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  23.73 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4662  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  26.82 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  0.408285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>