280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49601 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_49601  alanine glyoxylate aminotransferase  100 
 
 		 465 aa  961    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000836807  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4141  serine-pyruvate aminotransferase  51.76 
 
 		 375 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6685  putative serine-pyruvate aminotransferase  51.89 
 
 		 375 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2393  aminotransferase  54.52 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.777426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3723  aminotransferase, class V  50.63 
 
 		 376 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0562  serine-pyruvate aminotransferase  52.63 
 
 		 375 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4044  aminotransferase class V  51.26 
 
 		 375 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3477  aminotransferase, class V  51.26 
 
 		 375 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2722  aminotransferase, class V  51.26 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0163683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2675  aminotransferase, class V  51.39 
 
 		 375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2300  aminotransferase, class V  51.67 
 
 		 374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3136  serine-pyruvate transaminase  49.62 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5870  aminotransferase class V  50.5 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4989  aminotransferase class V  51.01 
 
 		 375 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3621  aminotransferase class V  51.26 
 
 		 375 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0255  putative serine-pyruvate aminotransferase  52.63 
 
 		 375 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3240  aminotransferase class V  52.99 
 
 		 375 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331017  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2112  Serine-pyruvate aminotransferase/ aspartate aminotransferase-like protein  51.13 
 
 		 382 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4464  aminotransferase, class V  50.37 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1367  aminotransferase, class V  49.38 
 
 		 382 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4174  aminotransferase, class V  51.39 
 
 		 403 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1241  aminotransferase, class V  52.2 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1782  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 377 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0461  aminotransferase, class V  50.25 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0177  serine-pyruvate aminotransferase  49.5 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0190  aminotransferase, class V  49.38 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3691  aminotransferase, class V  48.87 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0654  aminotransferase, class V  50.76 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.360401  normal  0.15732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1868  serine-pyruvate aminotransferase  51.26 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0517  aminotransferase, class V  51.26 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1395  aminotransferase, class V  48.85 
 
 		 375 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18704  predicted protein  49.19 
 
 		 359 aa  368  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.018829 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0422  aminotransferase, class V  46.73 
 
 		 378 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1074  aminotransferase class V  47.24 
 
 		 380 aa  357  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0414  aminotransferase class V  45.73 
 
 		 378 aa  351  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0640  aminotransferase, class V  45.41 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  28.81 
 
 		 367 aa  97.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0828  aminotransferase, class V  27.14 
 
 		 383 aa  93.2  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44075  predicted protein  21.93 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05470  alanine-glyoxylate transaminase, putative  23.78 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  25 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  26.93 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  27.65 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  25.31 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  25.38 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  25.13 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  24.73 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0406  aminotransferase class V  24.93 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.472989  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  23.88 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  23.94 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2895  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  25.56 
 
 		 371 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.011056 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  25.65 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  26.84 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  26.84 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  26.92 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  26.33 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  29.96 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  25.71 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  22.16 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  28.64 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  30.53 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  22.68 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  27.59 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2700  alanine--glyoxylate aminotransferase  23.64 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265577  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1910  alanine--glyoxylate aminotransferase  23.64 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0577107  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  24.54 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2047  alanine--glyoxylate aminotransferase  23.64 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000188057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3219  alanine--glyoxylate aminotransferase  23.64 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000141381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3165  aminotransferase, class V  23.64 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00663559  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  23.3 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0866  alanine--glyoxylate aminotransferase  23.64 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3204  aminotransferase, class V  23.64 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  25.71 
 
 		 378 aa  63.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  25 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  23.42 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  23 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0967  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  25.13 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00178187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000767  2-aminoethylphosphonate:pyruvate aminotransferase  24.66 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  25.39 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  25.86 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  24.94 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  24.41 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  25.46 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  26.05 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  24.35 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0463  aminotransferase, class V  45.45 
 
 		 88 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.55243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  21.45 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  24.74 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  24.46 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  24.41 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  26.43 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  24.42 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  29.85 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  27.99 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  24.59 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  27.31 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  25.63 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0546  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  23.92 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000447311  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2312  2-aminoethylphosphonate/pyruvate transaminase  24.38 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  26.96 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>