More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3723 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3723  aminotransferase, class V  100 
 
 		 376 aa  772    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3136  serine-pyruvate transaminase  77.87 
 
 		 377 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1782  aminotransferase class V  77.6 
 
 		 377 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4044  aminotransferase class V  73.33 
 
 		 375 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3477  aminotransferase, class V  73.07 
 
 		 375 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2675  aminotransferase, class V  73.07 
 
 		 375 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3240  aminotransferase class V  74.33 
 
 		 375 aa  585  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4464  aminotransferase, class V  73.12 
 
 		 384 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5870  aminotransferase class V  71.73 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0255  putative serine-pyruvate aminotransferase  72.27 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3621  aminotransferase class V  72 
 
 		 375 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4989  aminotransferase class V  72.27 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.576643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6685  putative serine-pyruvate aminotransferase  71.39 
 
 		 375 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0562  serine-pyruvate aminotransferase  70.67 
 
 		 375 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4141  serine-pyruvate aminotransferase  71.2 
 
 		 375 aa  569  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0461  aminotransferase, class V  70.86 
 
 		 386 aa  559  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2722  aminotransferase, class V  69.6 
 
 		 376 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0163683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4174  aminotransferase, class V  70.86 
 
 		 403 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3691  aminotransferase, class V  70.13 
 
 		 375 aa  554  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1367  aminotransferase, class V  65.24 
 
 		 382 aa  538  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0422  aminotransferase, class V  66.84 
 
 		 378 aa  525  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0414  aminotransferase class V  66.31 
 
 		 378 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2393  aminotransferase  67.47 
 
 		 376 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.777426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0640  aminotransferase, class V  64.71 
 
 		 379 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1074  aminotransferase class V  63.9 
 
 		 380 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2112  Serine-pyruvate aminotransferase/ aspartate aminotransferase-like protein  62.96 
 
 		 382 aa  503  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0654  aminotransferase, class V  66.4 
 
 		 375 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.360401  normal  0.15732 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1241  aminotransferase, class V  63.56 
 
 		 376 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2300  aminotransferase, class V  64.67 
 
 		 374 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0177  serine-pyruvate aminotransferase  60.37 
 
 		 378 aa  490  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1868  serine-pyruvate aminotransferase  65.6 
 
 		 375 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0190  aminotransferase, class V  61.17 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0517  aminotransferase, class V  65.6 
 
 		 375 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1395  aminotransferase, class V  61.56 
 
 		 375 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49601  alanine glyoxylate aminotransferase  50.63 
 
 		 465 aa  411  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000836807  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18704  predicted protein  54.6 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.018829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  29.39 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0828  aminotransferase, class V  28.53 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05470  alanine-glyoxylate transaminase, putative  27.27 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0406  aminotransferase class V  27.68 
 
 		 384 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.472989  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0463  aminotransferase, class V  64.38 
 
 		 88 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.55243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  25.43 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  28.09 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  23.63 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  23.31 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  28.61 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  23.18 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  23.18 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  22.99 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1404  alanine--glyoxylate aminotransferase  27.76 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000379047  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44075  predicted protein  24.93 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  26.12 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  22.44 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  30.22 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  24.79 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01342  hypothetical alanine--glyoxylate aminotransferase (Eurofung)  26.57 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000773374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  26.87 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  27.43 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  25.77 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  24.7 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  25.35 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  27.88 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  26.56 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  24.16 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  22.16 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  22.44 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  25.27 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  30 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  27.17 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  30.52 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  30 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  26.87 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  25.26 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  26.87 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0791  aminotransferase class V  27.91 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.644742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  26.87 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  26.26 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2556  aminotransferase class V  29.8 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  25.61 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  25.59 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  26.87 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  29.03 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  24.23 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2047  alanine--glyoxylate aminotransferase  27.35 
 
 		 404 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000188057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  27.73 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  26.16 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3219  alanine--glyoxylate aminotransferase  27.35 
 
 		 404 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000141381  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  26.16 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3204  aminotransferase, class V  27.35 
 
 		 404 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0866  alanine--glyoxylate aminotransferase  27.35 
 
 		 404 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000382013  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0344  aminotransferase, class V  28.98 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3165  aminotransferase, class V  27.35 
 
 		 404 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00663559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0828  aminotransferase, class V  28.98 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0287206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  23.9 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3920  aminotransferase, class V  28.98 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84351  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2700  alanine--glyoxylate aminotransferase  26.94 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265577  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0724  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  25.98 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  23.2 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0707  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>