101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4821 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  51.45 
 
 		 653 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  52.11 
 
 		 653 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  50.87 
 
 		 648 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  80.55 
 
 		 663 aa  1110    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  55.5 
 
 		 657 aa  715    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  49.31 
 
 		 660 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  51.46 
 
 		 662 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  49.76 
 
 		 675 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  51.92 
 
 		 654 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  53.56 
 
 		 621 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  52.22 
 
 		 653 aa  666    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  49.54 
 
 		 658 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  49.7 
 
 		 659 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  52.53 
 
 		 677 aa  673    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 		 658 aa  668    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  52.34 
 
 		 652 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  51.41 
 
 		 648 aa  687    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 661 aa  1349    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  49.7 
 
 		 655 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  52.42 
 
 		 656 aa  726    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  51.76 
 
 		 655 aa  717    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  53.23 
 
 		 657 aa  719    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  51.45 
 
 		 657 aa  716    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  46.34 
 
 		 653 aa  628  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  46.55 
 
 		 651 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  46.32 
 
 		 654 aa  620  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  48.3 
 
 		 1290 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  46.4 
 
 		 651 aa  618  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  48.89 
 
 		 636 aa  617  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  46.57 
 
 		 667 aa  609  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  48.43 
 
 		 658 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  48.43 
 
 		 658 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  48.87 
 
 		 629 aa  590  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.72 
 
 		 617 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.73 
 
 		 661 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  44.68 
 
 		 660 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  46.92 
 
 		 631 aa  581  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.99 
 
 		 661 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  45.75 
 
 		 661 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  45.75 
 
 		 661 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  45.26 
 
 		 661 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  45.43 
 
 		 661 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  45.26 
 
 		 661 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  42.9 
 
 		 661 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  46.83 
 
 		 626 aa  556  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  46.07 
 
 		 611 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  43.73 
 
 		 701 aa  545  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  44.39 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  43.44 
 
 		 670 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  45.08 
 
 		 696 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  46.54 
 
 		 625 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  46.54 
 
 		 625 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  44.81 
 
 		 628 aa  535  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  43.49 
 
 		 680 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  46.38 
 
 		 625 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  43.33 
 
 		 655 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  43.61 
 
 		 641 aa  522  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  43.72 
 
 		 625 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  42.52 
 
 		 659 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  41.87 
 
 		 700 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  38.73 
 
 		 687 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  40.62 
 
 		 654 aa  500  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  40.76 
 
 		 704 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  40.68 
 
 		 704 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  38.29 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  43.74 
 
 		 609 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  42.16 
 
 		 669 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  43.22 
 
 		 645 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  40.72 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.76 
 
 		 663 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  39.61 
 
 		 668 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  39.16 
 
 		 653 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.38 
 
 		 666 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  40.84 
 
 		 661 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  40.09 
 
 		 662 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  39.64 
 
 		 662 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 		 662 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  39.16 
 
 		 673 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  39.64 
 
 		 662 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  37.99 
 
 		 663 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  41.49 
 
 		 657 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  36.91 
 
 		 683 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  30.59 
 
 		 595 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  30.58 
 
 		 635 aa  269  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  35.33 
 
 		 357 aa  216  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  30.44 
 
 		 591 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0512  beta-lactamase domain protein  43.94 
 
 		 225 aa  181  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 		 425 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  28.05 
 
 		 491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 		 441 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 444 aa  146  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  23.15 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0511  hypothetical protein  56.45 
 
 		 67 aa  77.8  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  22.95 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  22.33 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  21.92 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  22.58 
 
 		 417 aa  60.1  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  22.2 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  23.09 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>