86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0511 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0511  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  140  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  75 
 
 		 700 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  75.76 
 
 		 653 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  78.12 
 
 		 617 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  69.7 
 
 		 687 aa  104  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  75 
 
 		 651 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  75 
 
 		 651 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  71.88 
 
 		 704 aa  103  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  73.85 
 
 		 654 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  70.77 
 
 		 691 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  68.75 
 
 		 680 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  67.69 
 
 		 701 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  68.75 
 
 		 704 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  69.84 
 
 		 660 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  69.84 
 
 		 654 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  67.19 
 
 		 607 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  66.67 
 
 		 657 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  68.33 
 
 		 658 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  66.67 
 
 		 658 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  62.5 
 
 		 653 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  60.94 
 
 		 657 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  62.5 
 
 		 653 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  65.08 
 
 		 652 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  64.52 
 
 		 629 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  64.52 
 
 		 1290 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  60.94 
 
 		 611 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  61.9 
 
 		 631 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  59.38 
 
 		 625 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  59.38 
 
 		 626 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  58.21 
 
 		 641 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  59.38 
 
 		 625 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  59.38 
 
 		 625 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  58.06 
 
 		 663 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  63.49 
 
 		 657 aa  80.9  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  70.37 
 
 		 609 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  56.72 
 
 		 625 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  60.32 
 
 		 667 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  59.38 
 
 		 628 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  57.14 
 
 		 662 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  57.58 
 
 		 663 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  57.14 
 
 		 675 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  56.45 
 
 		 661 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  58.73 
 
 		 653 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  64.41 
 
 		 662 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  59.32 
 
 		 696 aa  77  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  62.71 
 
 		 662 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  62.71 
 
 		 662 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  62.71 
 
 		 662 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  63.79 
 
 		 673 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  66.07 
 
 		 661 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  61.82 
 
 		 659 aa  74.7  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.84 
 
 		 661 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.84 
 
 		 661 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  60.34 
 
 		 655 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  54.69 
 
 		 657 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  60.34 
 
 		 666 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  58.46 
 
 		 677 aa  73.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  57.89 
 
 		 661 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  54.69 
 
 		 656 aa  73.9  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  57.89 
 
 		 661 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  57.89 
 
 		 661 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  57.89 
 
 		 661 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  57.89 
 
 		 661 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  53.97 
 
 		 661 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  56.25 
 
 		 645 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  50.75 
 
 		 654 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  62.3 
 
 		 663 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  53.23 
 
 		 673 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  54.69 
 
 		 669 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  47.76 
 
 		 683 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  58.18 
 
 		 670 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  51.67 
 
 		 648 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  46.15 
 
 		 636 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  48.44 
 
 		 655 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  53.57 
 
 		 648 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  49.15 
 
 		 621 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  53.7 
 
 		 668 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  43.75 
 
 		 660 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  45.31 
 
 		 658 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  45.31 
 
 		 659 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  45.31 
 
 		 655 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  45.31 
 
 		 658 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  58.93 
 
 		 653 aa  60.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  40.74 
 
 		 491 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  40 
 
 		 635 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 		 425 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>