109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1246 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  71.75 
 
 		 663 aa  1004    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 663 aa  1371    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  71.6 
 
 		 662 aa  1002    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  71.75 
 
 		 662 aa  1005    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  68.86 
 
 		 666 aa  988    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  71.26 
 
 		 661 aa  1003    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  71.15 
 
 		 662 aa  998    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  70.06 
 
 		 673 aa  993    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  71.3 
 
 		 662 aa  999    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  41.17 
 
 		 683 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  43.1 
 
 		 651 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  43.51 
 
 		 660 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  43.1 
 
 		 651 aa  505  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  42.33 
 
 		 658 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  41.9 
 
 		 658 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  41.19 
 
 		 680 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  44.52 
 
 		 653 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  41.5 
 
 		 653 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  42.52 
 
 		 654 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  40.27 
 
 		 662 aa  475  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  41.15 
 
 		 657 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  40.92 
 
 		 655 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  38.93 
 
 		 663 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  40.59 
 
 		 691 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  41.59 
 
 		 667 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  40.62 
 
 		 659 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 656 aa  465  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 		 657 aa  460  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  40.47 
 
 		 701 aa  461  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  41.21 
 
 		 658 aa  461  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  41.52 
 
 		 661 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 658 aa  458  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  41.52 
 
 		 661 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  40.97 
 
 		 661 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.24 
 
 		 617 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.49 
 
 		 661 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  41.21 
 
 		 661 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  41.05 
 
 		 661 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  40.97 
 
 		 661 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  38.82 
 
 		 660 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  39.59 
 
 		 700 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 687 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.37 
 
 		 661 aa  452  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 655 aa  449  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  40.57 
 
 		 704 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  39.09 
 
 		 661 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  40.43 
 
 		 657 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 		 704 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  38.79 
 
 		 653 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  41.64 
 
 		 631 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  39.16 
 
 		 652 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  39.08 
 
 		 675 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  39.56 
 
 		 636 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  38.47 
 
 		 677 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  39.47 
 
 		 653 aa  429  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  41.29 
 
 		 654 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  36.83 
 
 		 648 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  41.52 
 
 		 1290 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  39.02 
 
 		 673 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 		 670 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  38.57 
 
 		 653 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 		 696 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  36.21 
 
 		 648 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  38.81 
 
 		 655 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  38.47 
 
 		 621 aa  412  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  39.06 
 
 		 629 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  39.14 
 
 		 659 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  37.71 
 
 		 626 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  37.42 
 
 		 611 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 		 669 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 		 628 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  38.7 
 
 		 668 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  39.45 
 
 		 641 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  37.01 
 
 		 625 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  38.18 
 
 		 625 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  38.18 
 
 		 625 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  38.18 
 
 		 625 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  37.44 
 
 		 645 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 		 657 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  40.28 
 
 		 607 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  38.86 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  35.54 
 
 		 654 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  39.38 
 
 		 357 aa  239  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 595 aa  193  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  23.69 
 
 		 635 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 425 aa  153  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  23.02 
 
 		 591 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0512  beta-lactamase domain protein  40.95 
 
 		 225 aa  145  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  24.82 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  26.35 
 
 		 441 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  23.8 
 
 		 491 aa  95.5  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  22.95 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  20.88 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  21.13 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0511  hypothetical protein  62.3 
 
 		 67 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  22.1 
 
 		 414 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  22.18 
 
 		 417 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  21.88 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  21.63 
 
 		 417 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  30.23 
 
 		 359 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>