112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2280 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  100 
 
 
655 aa  1344    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  52.22 
 
 
673 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  50.3 
 
 
670 aa  680    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  50.15 
 
 
696 aa  668    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  45.08 
 
 
651 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  44.1 
 
 
657 aa  559  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  44.92 
 
 
651 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  44.91 
 
 
654 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  45.59 
 
 
653 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  45.87 
 
 
648 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  43.65 
 
 
653 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  44.55 
 
 
662 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  44.5 
 
 
675 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  43.85 
 
 
656 aa  541  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  45.31 
 
 
648 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  46.03 
 
 
631 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  45.48 
 
 
652 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.15 
 
 
617 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  43.35 
 
 
657 aa  532  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  46.73 
 
 
621 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  44.99 
 
 
657 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  42.19 
 
 
659 aa  531  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  45.3 
 
 
677 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  42.15 
 
 
663 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  43.61 
 
 
655 aa  527  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  44.22 
 
 
653 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  43.33 
 
 
661 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  43.9 
 
 
661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  43.9 
 
 
661 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  44.07 
 
 
653 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  44.26 
 
 
658 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  45.81 
 
 
654 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  43.9 
 
 
661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  43.9 
 
 
661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  41.03 
 
 
660 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  43.85 
 
 
658 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  43.58 
 
 
661 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  44.25 
 
 
653 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  45.09 
 
 
626 aa  511  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  44.56 
 
 
687 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.41 
 
 
661 aa  510  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.51 
 
 
661 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 
659 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  44.29 
 
 
629 aa  506  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  42.68 
 
 
655 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  42.83 
 
 
701 aa  505  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  42.18 
 
 
658 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  41.22 
 
 
658 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  41.45 
 
 
660 aa  498  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  42.12 
 
 
691 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  41.07 
 
 
667 aa  498  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  41.15 
 
 
680 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  42.74 
 
 
625 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  46.49 
 
 
661 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  41.55 
 
 
1290 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  43.84 
 
 
607 aa  485  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  43.36 
 
 
625 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  43.36 
 
 
625 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  44.54 
 
 
609 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  42.28 
 
 
641 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  43.19 
 
 
625 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  41.81 
 
 
669 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  44.6 
 
 
645 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  40.65 
 
 
611 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  40.42 
 
 
700 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  41.27 
 
 
636 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  41.83 
 
 
628 aa  462  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  39.33 
 
 
654 aa  449  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  39.73 
 
 
704 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  39.57 
 
 
704 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  38.81 
 
 
663 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 
673 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.95 
 
 
663 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 
662 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.46 
 
 
666 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  38.11 
 
 
662 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  36.9 
 
 
661 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 
657 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  37.95 
 
 
662 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  36.76 
 
 
668 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  37.64 
 
 
662 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 
683 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 
595 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  28.14 
 
 
635 aa  240  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
591 aa  213  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  35.03 
 
 
357 aa  209  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 
425 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 
441 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 
444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0512  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 
225 aa  160  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  25.06 
 
 
408 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  21.54 
 
 
491 aa  82.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  20.65 
 
 
477 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  22.15 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  26.75 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  23.65 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0511  hypothetical protein  48.44 
 
 
67 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  23.28 
 
 
299 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>