103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1606 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 		 663 aa  1364    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  71.75 
 
 		 663 aa  1004    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  93.02 
 
 		 662 aa  1278    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  93.17 
 
 		 662 aa  1278    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  72.85 
 
 		 666 aa  1033    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  75.87 
 
 		 661 aa  1057    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  92.72 
 
 		 662 aa  1274    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  72.9 
 
 		 673 aa  1037    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  92.87 
 
 		 662 aa  1275    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  45.07 
 
 		 683 aa  569  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  44.25 
 
 		 651 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  44.25 
 
 		 651 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  42.58 
 
 		 680 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  44.65 
 
 		 660 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  42.9 
 
 		 658 aa  512  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  42.64 
 
 		 658 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  40.51 
 
 		 691 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  43.12 
 
 		 653 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 		 704 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  43.37 
 
 		 653 aa  492  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  41.4 
 
 		 662 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  41.42 
 
 		 704 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  40.39 
 
 		 687 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  41.43 
 
 		 701 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  42.72 
 
 		 657 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  43.01 
 
 		 667 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  41.56 
 
 		 654 aa  479  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  42.97 
 
 		 656 aa  477  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  42.5 
 
 		 657 aa  475  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  40.41 
 
 		 700 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  41.76 
 
 		 661 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  40.22 
 
 		 663 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  40.72 
 
 		 658 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  41.13 
 
 		 661 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.57 
 
 		 617 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.31 
 
 		 661 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  40.39 
 
 		 655 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  41.13 
 
 		 661 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  41.5 
 
 		 661 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  41.76 
 
 		 652 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 655 aa  458  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  40.82 
 
 		 661 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  41.54 
 
 		 660 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.16 
 
 		 661 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  39.94 
 
 		 659 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 		 661 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  40.82 
 
 		 661 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  38.81 
 
 		 648 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  40.16 
 
 		 653 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  39.97 
 
 		 658 aa  452  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  42.59 
 
 		 631 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  41.51 
 
 		 657 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 		 675 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  41.68 
 
 		 654 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  39.06 
 
 		 673 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  37.75 
 
 		 648 aa  439  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 653 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  40.89 
 
 		 621 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  39.13 
 
 		 677 aa  435  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  42.48 
 
 		 1290 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  40.16 
 
 		 636 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  38.01 
 
 		 696 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  39.12 
 
 		 653 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 		 670 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  37.62 
 
 		 659 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  38.21 
 
 		 611 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  37.95 
 
 		 655 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 		 629 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 669 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  37.3 
 
 		 626 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  36.68 
 
 		 628 aa  389  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  37.52 
 
 		 625 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  37.52 
 
 		 625 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 		 625 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  37.95 
 
 		 654 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 625 aa  382  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  36.65 
 
 		 645 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 		 641 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 		 609 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  36.84 
 
 		 668 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  37.74 
 
 		 657 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 607 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  39.51 
 
 		 357 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  26.38 
 
 		 595 aa  218  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  24.73 
 
 		 635 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 591 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  27.12 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0512  beta-lactamase domain protein  40.18 
 
 		 225 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 444 aa  130  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  24.94 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  23.14 
 
 		 491 aa  87.8  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  22.06 
 
 		 477 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  21.88 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0511  hypothetical protein  57.58 
 
 		 67 aa  78.2  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  21.21 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  22.1 
 
 		 414 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  21.05 
 
 		 417 aa  53.5  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  21.14 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  21.11 
 
 		 417 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  20.41 
 
 		 417 aa  48.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>