97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0512 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0512  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.758744 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  56.68 
 
 		 701 aa  278  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  57.08 
 
 		 680 aa  275  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  54.03 
 
 		 687 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  52.31 
 
 		 691 aa  252  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  54.21 
 
 		 704 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  53.27 
 
 		 704 aa  241  9e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  52.36 
 
 		 651 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  50.93 
 
 		 660 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  50.9 
 
 		 700 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  52.36 
 
 		 651 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  52.78 
 
 		 658 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  52.31 
 
 		 658 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  51.87 
 
 		 653 aa  225  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  50.51 
 
 		 654 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.02 
 
 		 617 aa  205  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  49.26 
 
 		 648 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  50.24 
 
 		 654 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  45.66 
 
 		 654 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  46.12 
 
 		 662 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  43.06 
 
 		 655 aa  194  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  44.95 
 
 		 696 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  44.5 
 
 		 657 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  48.28 
 
 		 641 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  48.79 
 
 		 652 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  52.94 
 
 		 636 aa  191  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  46.19 
 
 		 653 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  47.78 
 
 		 648 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  48.77 
 
 		 625 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 		 658 aa  188  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  44.12 
 
 		 673 aa  188  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  48.45 
 
 		 611 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  47.47 
 
 		 626 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  45.92 
 
 		 659 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  45.92 
 
 		 658 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  42.4 
 
 		 670 aa  184  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  45.41 
 
 		 655 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  45.36 
 
 		 677 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  45.92 
 
 		 660 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  48.24 
 
 		 629 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  40.83 
 
 		 657 aa  182  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  40.67 
 
 		 656 aa  182  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  48.19 
 
 		 675 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  43.94 
 
 		 661 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  52.31 
 
 		 625 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  52.31 
 
 		 625 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  52.33 
 
 		 625 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  49.25 
 
 		 659 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  44.39 
 
 		 663 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  42.51 
 
 		 653 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  42.51 
 
 		 653 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  43.59 
 
 		 628 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  42.93 
 
 		 657 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  42.18 
 
 		 667 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  45.92 
 
 		 631 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  41.83 
 
 		 661 aa  168  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.95 
 
 		 661 aa  168  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.95 
 
 		 661 aa  168  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  45.69 
 
 		 621 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  40.27 
 
 		 1290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  39.52 
 
 		 661 aa  164  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  39.52 
 
 		 661 aa  164  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 		 661 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  42.42 
 
 		 607 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  44 
 
 		 653 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  39.05 
 
 		 661 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  39.05 
 
 		 661 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  38.83 
 
 		 655 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  40.45 
 
 		 669 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  41.01 
 
 		 668 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  45.64 
 
 		 609 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 		 673 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 		 661 aa  148  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  41.97 
 
 		 645 aa  145  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.48 
 
 		 666 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  40.95 
 
 		 663 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  41.1 
 
 		 662 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  41.1 
 
 		 662 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  41.1 
 
 		 662 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  41.1 
 
 		 662 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.18 
 
 		 663 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 683 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  37.7 
 
 		 657 aa  124  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 595 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  29.8 
 
 		 635 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  31.37 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  39.24 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 		 591 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  39.47 
 
 		 425 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  30.11 
 
 		 340 aa  46.2  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  33.87 
 
 		 337 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 		 316 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  35.37 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 310 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 307 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  36.21 
 
 		 318 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 307 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>