194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4962 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
417 aa  858    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  44.28 
 
 
441 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  38.56 
 
 
477 aa  274  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 
417 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
444 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  29.13 
 
 
417 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 
425 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  26.34 
 
 
417 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  28.61 
 
 
591 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  25.87 
 
 
1290 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 
607 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  22.87 
 
 
635 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  23.38 
 
 
657 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  24.83 
 
 
611 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 
631 aa  77.4  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  24.94 
 
 
670 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  23.8 
 
 
655 aa  76.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  23.32 
 
 
657 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 
654 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  25 
 
 
662 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  24.47 
 
 
659 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  22.84 
 
 
654 aa  69.3  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  25.18 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  22.81 
 
 
653 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  24.07 
 
 
648 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  22.78 
 
 
653 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 
696 aa  67  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  24.59 
 
 
628 aa  67  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  23.02 
 
 
662 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  23.02 
 
 
662 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  22.78 
 
 
662 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  23.2 
 
 
655 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  24.28 
 
 
658 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  22.35 
 
 
659 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  23.98 
 
 
653 aa  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  22.57 
 
 
658 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  23.2 
 
 
652 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  23.95 
 
 
319 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  23.89 
 
 
655 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  24.46 
 
 
658 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23 
 
 
617 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  23.84 
 
 
653 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  26.01 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.23 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 
662 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  23.26 
 
 
609 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 
625 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  22.68 
 
 
663 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  23.95 
 
 
319 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  22.8 
 
 
656 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  22.58 
 
 
661 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.39 
 
 
298 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  23.53 
 
 
319 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 
319 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  20.92 
 
 
673 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  24.88 
 
 
645 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  24.9 
 
 
319 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  22.05 
 
 
657 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  24.21 
 
 
641 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  23.76 
 
 
249 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  21.77 
 
 
677 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 
295 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  24.1 
 
 
648 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  24.73 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 
319 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.55 
 
 
661 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 
319 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 
321 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.55 
 
 
661 aa  57  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  22.3 
 
 
661 aa  57  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  24.03 
 
 
319 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  21.75 
 
 
667 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  22.36 
 
 
660 aa  56.6  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  22.75 
 
 
660 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  20 
 
 
661 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  23.32 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  24.72 
 
 
334 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  23.66 
 
 
362 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.37 
 
 
666 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
275 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  21.81 
 
 
691 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  24.79 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  21.38 
 
 
651 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  21.38 
 
 
651 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 
319 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 
339 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 
336 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
319 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
319 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 
332 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  23.6 
 
 
626 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.05 
 
 
663 aa  53.5  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  24.2 
 
 
318 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>