138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1373 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
417 aa  845    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  58.41 
 
 
417 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  62.81 
 
 
417 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 
441 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  31.55 
 
 
477 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  29.31 
 
 
417 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 
591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 
595 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 
425 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 
444 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 
441 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  22.25 
 
 
635 aa  86.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 
408 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  21.32 
 
 
657 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  24.46 
 
 
621 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  21.84 
 
 
655 aa  76.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  23.26 
 
 
648 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 
669 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 
654 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  23.61 
 
 
648 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  23.69 
 
 
659 aa  70.5  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  21.41 
 
 
651 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  21.97 
 
 
659 aa  69.7  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  21.41 
 
 
651 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 
654 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  21.97 
 
 
655 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  21.35 
 
 
661 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  24.27 
 
 
655 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 
636 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  21.35 
 
 
661 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  22.81 
 
 
656 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  22.2 
 
 
658 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  23.5 
 
 
1290 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  21.13 
 
 
661 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  21.13 
 
 
661 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  28.25 
 
 
645 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  22.22 
 
 
654 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  21.91 
 
 
661 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  23.17 
 
 
675 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.18 
 
 
661 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  21.93 
 
 
673 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  20.62 
 
 
670 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  21.13 
 
 
661 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  22.6 
 
 
662 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.99 
 
 
661 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 
657 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  21.81 
 
 
658 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  20.4 
 
 
657 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  24.94 
 
 
626 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  22.37 
 
 
658 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 
625 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  23.88 
 
 
607 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  21.27 
 
 
691 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  26.19 
 
 
667 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  21.33 
 
 
661 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 
677 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  20.56 
 
 
696 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 
652 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  21.3 
 
 
653 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  22.28 
 
 
653 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  21.92 
 
 
661 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  22.05 
 
 
660 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  22.95 
 
 
663 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  21.41 
 
 
680 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.35 
 
 
617 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  23.96 
 
 
611 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  20.93 
 
 
687 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 
653 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  21.48 
 
 
658 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  21.45 
 
 
662 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  21.61 
 
 
673 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  22.18 
 
 
663 aa  57  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.1 
 
 
298 aa  56.6  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  24.79 
 
 
438 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  21.25 
 
 
704 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  23.94 
 
 
625 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  21.45 
 
 
701 aa  55.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  21.25 
 
 
704 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.43 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  37.25 
 
 
331 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  22.49 
 
 
631 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  28.16 
 
 
653 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  24.04 
 
 
641 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  22.16 
 
 
357 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 
319 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  23.71 
 
 
625 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 
625 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  22.71 
 
 
668 aa  54.3  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.69 
 
 
666 aa  54.3  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  21.21 
 
 
662 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  25.75 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  25.75 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  24.89 
 
 
319 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 
299 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  21.21 
 
 
662 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  21.92 
 
 
629 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  24.67 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.01 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  21.21 
 
 
662 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>