131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5160 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  76.74 
 
 		 417 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  100 
 
 		 417 aa  850    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  58.41 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  28.42 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 591 aa  137  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 		 595 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  23.7 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  21.13 
 
 		 635 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  22.65 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  23.61 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 		 669 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  23.15 
 
 		 654 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  21.69 
 
 		 655 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  21.77 
 
 		 673 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  22.68 
 
 		 653 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  20.7 
 
 		 657 aa  73.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  26.75 
 
 		 655 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  22.99 
 
 		 696 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 		 636 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.33 
 
 		 617 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  22.17 
 
 		 651 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  22.17 
 
 		 651 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  23.01 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  22.45 
 
 		 654 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  22.69 
 
 		 662 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  22.4 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  21.4 
 
 		 655 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  22.76 
 
 		 660 aa  68.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  21.08 
 
 		 656 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  22.74 
 
 		 660 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  23.39 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  23.54 
 
 		 621 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  22.25 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  23.45 
 
 		 611 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  21.06 
 
 		 658 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  21.25 
 
 		 658 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  21.91 
 
 		 670 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 		 704 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  21.06 
 
 		 659 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  23.58 
 
 		 654 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  22.43 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  21.63 
 
 		 1290 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  25.14 
 
 		 704 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  22.3 
 
 		 607 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  23.34 
 
 		 626 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  22.76 
 
 		 661 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  23.62 
 
 		 675 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  22.19 
 
 		 701 aa  60.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  22.76 
 
 		 631 aa  60.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  23.38 
 
 		 648 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  21.68 
 
 		 691 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  28.83 
 
 		 625 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 625 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  21.14 
 
 		 661 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  21.78 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  25.94 
 
 		 663 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  23.43 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  20.65 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  23.77 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.69 
 
 		 663 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  23.69 
 
 		 641 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  19.86 
 
 		 661 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  21.08 
 
 		 662 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  19.86 
 
 		 661 aa  57  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  21.08 
 
 		 662 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  20.6 
 
 		 662 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  24.19 
 
 		 609 aa  56.6  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  20.67 
 
 		 687 aa  56.6  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  19.63 
 
 		 661 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  23.39 
 
 		 628 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  25.58 
 
 		 645 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  19.63 
 
 		 661 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 659 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  23.22 
 
 		 658 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.66 
 
 		 661 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  21.13 
 
 		 661 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.66 
 
 		 661 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  23.1 
 
 		 653 aa  53.9  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  20.61 
 
 		 661 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 		 332 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  23.2 
 
 		 653 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.22 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  23.24 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  22.43 
 
 		 625 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.11 
 
 		 666 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  21.45 
 
 		 677 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  28.64 
 
 		 323 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.29 
 
 		 319 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  21.53 
 
 		 668 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  23.76 
 
 		 700 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 		 332 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 321 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  26.29 
 
 		 335 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  26.29 
 
 		 335 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>