95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0510 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0510  conserved hypothetical beta-lactamase  100 
 
 		 357 aa  732    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.618427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  66.46 
 
 		 704 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  66.46 
 
 		 704 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  61.49 
 
 		 700 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  61.25 
 
 		 680 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  60.12 
 
 		 691 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  59.63 
 
 		 687 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  59.69 
 
 		 701 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  49.54 
 
 		 660 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  48.74 
 
 		 658 aa  318  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  48.74 
 
 		 658 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  39.75 
 
 		 657 aa  268  7e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 656 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  39.06 
 
 		 657 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  41.01 
 
 		 655 aa  266  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  40.06 
 
 		 653 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  39.74 
 
 		 653 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.3 
 
 		 666 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  38.99 
 
 		 660 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 		 651 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  38.8 
 
 		 662 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 		 651 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 		 654 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.99 
 
 		 617 aa  256  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 		 658 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  38.8 
 
 		 655 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  38.49 
 
 		 659 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  41.43 
 
 		 673 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  39.81 
 
 		 662 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  38.36 
 
 		 658 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  39.75 
 
 		 667 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 		 662 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 		 662 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.51 
 
 		 663 aa  248  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  38.12 
 
 		 654 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 		 662 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  38.68 
 
 		 653 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  39.31 
 
 		 636 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 		 631 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 		 661 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  37.42 
 
 		 652 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  37.42 
 
 		 648 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  39.38 
 
 		 663 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  37.74 
 
 		 653 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  38.99 
 
 		 657 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  37.42 
 
 		 648 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  37.69 
 
 		 1290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  41.69 
 
 		 629 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  36.48 
 
 		 621 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 		 677 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  38.68 
 
 		 611 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  34.38 
 
 		 663 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  37.26 
 
 		 696 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  37.94 
 
 		 653 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  35.33 
 
 		 661 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  36.53 
 
 		 683 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  36.1 
 
 		 675 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.59 
 
 		 661 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.59 
 
 		 661 aa  212  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  34.91 
 
 		 661 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  34.91 
 
 		 661 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  37.81 
 
 		 628 aa  210  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  35.03 
 
 		 655 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  34.28 
 
 		 661 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  34.28 
 
 		 661 aa  209  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  34.8 
 
 		 661 aa  209  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  34.28 
 
 		 661 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  32.7 
 
 		 654 aa  209  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  35.58 
 
 		 673 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 		 659 aa  200  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  34.08 
 
 		 670 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  34.8 
 
 		 626 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 		 609 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 669 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  36.91 
 
 		 645 aa  185  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 		 625 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  33.54 
 
 		 625 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 		 625 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 625 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  32.47 
 
 		 668 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  39.66 
 
 		 641 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 		 607 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 		 657 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 		 595 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  21.71 
 
 		 635 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 		 591 aa  97.4  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  25.93 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2022  Alkyl sulfatase and related hydrolase-like protein  22.54 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  22.16 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  23.38 
 
 		 441 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  24.06 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  24.52 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>