More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0796 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0796  histidine kinase  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 419 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 720 aa  97.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 755 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  33.18 
 
 		 367 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 867 aa  92.4  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  34.4 
 
 		 367 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 766 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 543 aa  89.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  32.56 
 
 		 613 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  30.45 
 
 		 608 aa  89  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.45 
 
 		 608 aa  89  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  30.45 
 
 		 608 aa  89  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  30.45 
 
 		 608 aa  89  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  30.45 
 
 		 608 aa  89  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 600 aa  88.6  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0128  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 780 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000607213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  30.3 
 
 		 617 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.26 
 
 		 490 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  30.52 
 
 		 458 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  30.28 
 
 		 412 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  30.52 
 
 		 458 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  30.45 
 
 		 608 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  30.52 
 
 		 458 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  30.05 
 
 		 458 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 591 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  32.57 
 
 		 471 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 378 aa  86.3  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 471 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  30.88 
 
 		 484 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 592 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3303  histidine kinase  32.05 
 
 		 449 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  30.05 
 
 		 458 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  29.58 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.749105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 765 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3109  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  30.05 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 492 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  30.15 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00245745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 564 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 491 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 525 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  30.7 
 
 		 661 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 581 aa  82  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 440 aa  82  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.139517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0752  sensor histidine kinase  28.86 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.980748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  25.35 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0125  histidine kinase  34.55 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.64 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  26.57 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 497 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 523 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 520 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0478  histidine kinase  30.43 
 
 		 555 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 586 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  24.88 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  32.09 
 
 		 573 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.14 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.785514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  28.7 
 
 		 550 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 498 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 525 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  29.79 
 
 		 855 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2855  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 599 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 494 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 595 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00296366  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 929 aa  79  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 661 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  29.34 
 
 		 363 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  25.35 
 
 		 498 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  32.99 
 
 		 490 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 661 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  31.7 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.36 
 
 		 679 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  31.4 
 
 		 620 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  28.97 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4896  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 842 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  24.88 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0824  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.93 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0420  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00956949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  28.37 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  30.17 
 
 		 830 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  25.38 
 
 		 498 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1351  sensor histidine kinase KinD  25.38 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.25 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  25.38 
 
 		 498 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>