63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3568 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  50.75 
 
 		 455 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  46.53 
 
 		 511 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  43.08 
 
 		 465 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  48.7 
 
 		 494 aa  158  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  45.36 
 
 		 460 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  45.79 
 
 		 504 aa  157  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  43.08 
 
 		 470 aa  153  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  44.9 
 
 		 474 aa  152  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  42.71 
 
 		 461 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  42.56 
 
 		 465 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  41.24 
 
 		 535 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  42.05 
 
 		 469 aa  147  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  40.74 
 
 		 534 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  45.31 
 
 		 524 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  39.2 
 
 		 465 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  44.33 
 
 		 480 aa  138  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  44.1 
 
 		 459 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  41.03 
 
 		 468 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  41.88 
 
 		 442 aa  118  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  27.1 
 
 		 477 aa  75.1  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  23.98 
 
 		 426 aa  58.2  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  28.19 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  30.34 
 
 		 457 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  28.76 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  27.34 
 
 		 240 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 417 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  36.22 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  26.83 
 
 		 263 aa  45.4  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2874  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0919365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 274 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 332 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.77 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2614  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  26.77 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  30.28 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  21.74 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  38.33 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.79 
 
 		 672 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 1340 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  22.36 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  30.28 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  30.97 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  30.28 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  39.62 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  41.07 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  30.65 
 
 		 303 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  29.81 
 
 		 254 aa  42.4  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31991  3,4-dihydroxy-5-hexaprenylbenzoate methyltransferase  28.46 
 
 		 280 aa  42  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  29.58 
 
 		 206 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2359  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 		 412 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 208 aa  42  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  30.65 
 
 		 471 aa  41.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>