23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3745 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  100 
 
 
459 aa  919    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  52.26 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  52.03 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  50.54 
 
 
461 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  51.42 
 
 
504 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  48.82 
 
 
460 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  46.55 
 
 
465 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  51.72 
 
 
470 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  51.39 
 
 
524 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  47.74 
 
 
465 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  49.68 
 
 
468 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  50.84 
 
 
474 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  50.44 
 
 
480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  49.18 
 
 
494 aa  405  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  50 
 
 
511 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  47.28 
 
 
455 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  43.47 
 
 
534 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  44.91 
 
 
442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  57.09 
 
 
535 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  44.1 
 
 
202 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  31.56 
 
 
477 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  24.73 
 
 
426 aa  53.5  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  37 
 
 
307 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>