42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6753 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  100 
 
 
504 aa  1001    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  61.31 
 
 
535 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  62.19 
 
 
474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  60.84 
 
 
470 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  58.08 
 
 
468 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  59.2 
 
 
511 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  56.02 
 
 
494 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  51.93 
 
 
461 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  56.2 
 
 
524 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  50.71 
 
 
534 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  53.55 
 
 
455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  55.4 
 
 
480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  49.4 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  46.96 
 
 
465 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  46.25 
 
 
465 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  49.2 
 
 
469 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  51.42 
 
 
459 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  44.85 
 
 
460 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  44.01 
 
 
442 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  45.79 
 
 
202 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  27.73 
 
 
477 aa  85.1  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  25.71 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  26.38 
 
 
242 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  25 
 
 
194 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
1340 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1162 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
257 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  34.59 
 
 
581 aa  48.5  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
194 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  35.9 
 
 
238 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31991  3,4-dihydroxy-5-hexaprenylbenzoate methyltransferase  31.16 
 
 
280 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751734  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 
332 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2080  methyltransferase type 12  35.92 
 
 
329 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0360  methyltransferase type 12  40.68 
 
 
201 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
349 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.37 
 
 
354 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  26.95 
 
 
358 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
262 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
268 aa  44.3  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2763  methyltransferase type 11  33.82 
 
 
306 aa  44.3  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.07 
 
 
277 aa  43.5  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  38.18 
 
 
213 aa  43.5  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>