22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4015 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  100 
 
 
534 aa  1070    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  55.74 
 
 
474 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  50.89 
 
 
504 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  51.01 
 
 
511 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  48.81 
 
 
494 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  45.03 
 
 
461 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  47.75 
 
 
468 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  45.3 
 
 
465 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  49.72 
 
 
524 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  47.38 
 
 
470 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  47.93 
 
 
455 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  42.88 
 
 
465 aa  419  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  46.4 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  40.79 
 
 
465 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  42.51 
 
 
469 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  42.27 
 
 
460 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  43.47 
 
 
459 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  40.95 
 
 
442 aa  312  9e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  56.27 
 
 
535 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  40.74 
 
 
202 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  27.95 
 
 
477 aa  87.8  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  25.57 
 
 
426 aa  64.3  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>