59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3284 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 465 aa  972    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  52.48 
 
 		 465 aa  511  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  52.59 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  50.75 
 
 		 465 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  46.25 
 
 		 504 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  47.97 
 
 		 460 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  47.17 
 
 		 524 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  44.95 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  46.04 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  47.19 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  46.55 
 
 		 459 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  44.33 
 
 		 494 aa  415  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  44.28 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  44.75 
 
 		 474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  43.68 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  40.79 
 
 		 534 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  43.99 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  39.43 
 
 		 442 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  46.54 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  42.56 
 
 		 202 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  24.73 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  28.11 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2649  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.03 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0578562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1711  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.64 
 
 		 447 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0226099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  29.6 
 
 		 394 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 246 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  28.8 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0271  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.28 
 
 		 413 aa  50.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.419642  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07375  conserved hypothetical protein  23.4 
 
 		 510 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  31.72 
 
 		 238 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2676  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.52 
 
 		 485 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1720  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.25 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0798  cyclopropane fatty acid synthase-like protein  26.83 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000275065  hitchhiker  2.13005e-17 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  29.06 
 
 		 201 aa  47.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.67 
 
 		 395 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2228  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.71 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.773726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1892  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.03 
 
 		 424 aa  46.6  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05688  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04190)  28.3 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1647  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.4 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0262651  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1363  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.19 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000012191  normal  0.473534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0913  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.63 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4606  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.58 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  hitchhiker  0.0000312822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.98 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1253  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.81 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.087118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4563  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 		 394 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  27.78 
 
 		 252 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.88 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.78 
 
 		 256 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  27.21 
 
 		 358 aa  43.9  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2162  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.81 
 
 		 397 aa  43.9  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.125639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 332 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.45 
 
 		 494 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  22.22 
 
 		 194 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 270 aa  43.5  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 243 aa  43.5  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.84 
 
 		 260 aa  43.1  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_2019  predicted protein  26.12 
 
 		 877 aa  43.1  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0204163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>