54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3501 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 455 aa  904    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  57.82 
 
 		 511 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  53.75 
 
 		 504 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  55.56 
 
 		 494 aa  477  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  54.39 
 
 		 468 aa  472  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  50.33 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  54.39 
 
 		 474 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  54.64 
 
 		 524 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  49.36 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  50.87 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  52.77 
 
 		 470 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  47.74 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  47.19 
 
 		 465 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  48.7 
 
 		 534 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  52.04 
 
 		 480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  47.98 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  48.15 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  45.82 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  55.73 
 
 		 535 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  50.75 
 
 		 202 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  30.64 
 
 		 477 aa  89.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  28.34 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.72 
 
 		 234 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.12 
 
 		 243 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 		 237 aa  49.7  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 		 237 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.19 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.07 
 
 		 236 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 1340 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0134  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.85 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200688  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  30.14 
 
 		 241 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31991  3,4-dihydroxy-5-hexaprenylbenzoate methyltransferase  27 
 
 		 280 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  35.26 
 
 		 349 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.11 
 
 		 234 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  38.28 
 
 		 354 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.82 
 
 		 232 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  38.28 
 
 		 342 aa  47  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 581 aa  46.6  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.58 
 
 		 391 aa  46.6  0.0009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  37.19 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 1523 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.34 
 
 		 242 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  25.77 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.46 
 
 		 260 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.63 
 
 		 266 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.07 
 
 		 247 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.06 
 
 		 254 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.51 
 
 		 241 aa  43.9  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 262 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  25.99 
 
 		 288 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0464  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.99 
 
 		 421 aa  43.5  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  35.77 
 
 		 237 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1283  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 		 440 aa  43.1  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.204658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>