44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0482 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  100 
 
 
470 aa  948    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  60.84 
 
 
504 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  56.84 
 
 
468 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  56.99 
 
 
474 aa  488  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  53.91 
 
 
494 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  53.91 
 
 
511 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  50.75 
 
 
461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  50.32 
 
 
469 aa  448  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  47.57 
 
 
534 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  52.15 
 
 
455 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  49.57 
 
 
465 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  52.63 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  51.4 
 
 
524 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  48.82 
 
 
465 aa  435  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  51.72 
 
 
459 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  45.91 
 
 
460 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  44.18 
 
 
465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  46.12 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  63.5 
 
 
535 aa  330  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  43.08 
 
 
202 aa  154  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  26.32 
 
 
477 aa  82.4  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  28.57 
 
 
426 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 
262 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31991  3,4-dihydroxy-5-hexaprenylbenzoate methyltransferase  32.06 
 
 
280 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751734  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1190  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.76 
 
 
241 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
277 aa  47.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
634 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  32.2 
 
 
238 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  26.19 
 
 
197 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 
263 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.47 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 
332 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0957  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.56 
 
 
235 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 
457 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
266 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0301  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.39 
 
 
392 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.29 
 
 
247 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.29 
 
 
236 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.87 
 
 
253 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.97 
 
 
246 aa  43.5  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1966  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 
264 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.54 
 
 
273 aa  43.5  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.33 
 
 
266 aa  43.1  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.43 
 
 
260 aa  43.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>