29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  100 
 
 
524 aa  1038    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  59.21 
 
 
494 aa  521  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  56.03 
 
 
504 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  60.17 
 
 
480 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  56.59 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  55.91 
 
 
468 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  55.6 
 
 
511 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  48.28 
 
 
535 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  48.31 
 
 
461 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  47.83 
 
 
465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  48.71 
 
 
465 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  49.53 
 
 
534 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  54.78 
 
 
455 aa  438  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  47.07 
 
 
465 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  49.78 
 
 
460 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  48.39 
 
 
469 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  50.1 
 
 
470 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  51.38 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  45.79 
 
 
442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  45.31 
 
 
202 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  27 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  26.87 
 
 
426 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  22.78 
 
 
194 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1042  hypothetical protein  30.43 
 
 
239 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
1312 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
194 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  23.31 
 
 
269 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  32.16 
 
 
417 aa  44.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
581 aa  43.5  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>