69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2767 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  100 
 
 		 465 aa  957    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  59.4 
 
 		 461 aa  571  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  57.97 
 
 		 465 aa  559  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  52.04 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  51.18 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  47.87 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  48.39 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  50.53 
 
 		 474 aa  478  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  47.73 
 
 		 494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  48.23 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  49.36 
 
 		 460 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  45.4 
 
 		 534 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  47.94 
 
 		 524 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  47.76 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  49.57 
 
 		 470 aa  448  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  48.17 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  47.85 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  40.88 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  49.24 
 
 		 535 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  39.2 
 
 		 202 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  26.81 
 
 		 477 aa  80.5  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  28.65 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  28.83 
 
 		 194 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  26.53 
 
 		 246 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 253 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  22.29 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 285 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 285 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 257 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 		 194 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 285 aa  47  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 206 aa  46.6  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 		 1340 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1809  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 780 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 634 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  31.54 
 
 		 263 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.33 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  25.93 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0810  hypothetical protein  27.78 
 
 		 239 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07375  conserved hypothetical protein  22.15 
 
 		 510 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.37 
 
 		 249 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  38.3 
 
 		 259 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.52 
 
 		 235 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.86 
 
 		 256 aa  44.3  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07040  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.237477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.82 
 
 		 240 aa  43.9  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.86 
 
 		 256 aa  43.9  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.82 
 
 		 240 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.18 
 
 		 260 aa  43.9  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 1312 aa  43.9  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2347  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 265 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.82 
 
 		 240 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  24.82 
 
 		 240 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.82 
 
 		 240 aa  43.9  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.82 
 
 		 240 aa  43.9  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1453  SAM-dependent methyltransferase  27.27 
 
 		 252 aa  43.5  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.938233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.82 
 
 		 240 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.85 
 
 		 256 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  26.09 
 
 		 394 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.52 
 
 		 244 aa  43.5  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  26.79 
 
 		 201 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.82 
 
 		 240 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 		 245 aa  43.5  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 225 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  25 
 
 		 257 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  24.61 
 
 		 1523 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 2112 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>