28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1194 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1194  Methyltransferase type 12  100 
 
 
480 aa  940    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268598  normal  0.023424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37640  methyltransferase family protein  60 
 
 
524 aa  498  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3132  Methyltransferase type 12  56.81 
 
 
494 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.058423  hitchhiker  0.0000598488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6753  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  55.4 
 
 
504 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.549173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1722  Methyltransferase type 12  56.06 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0943  Methyltransferase type 12  54.51 
 
 
468 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2767  methyltransferase type 12  47.97 
 
 
465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1976  methyltransferase type 12  48.94 
 
 
465 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.019973  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0482  Methyltransferase type 12  52.63 
 
 
470 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5515  Methyltransferase type 12  52.38 
 
 
511 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1594  hypothetical protein  47.75 
 
 
461 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00372727  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4015  methyltransferase type 12  46.4 
 
 
534 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.20547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3501  Methyltransferase type 12  52.04 
 
 
455 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.280234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2985  methyltransferase type 12  48.37 
 
 
460 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3284  Methyltransferase type 12  43.68 
 
 
465 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3745  hypothetical protein  50.44 
 
 
459 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946661  normal  0.0367829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0171  methyltransferase type 12  45.97 
 
 
469 aa  393  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.738928  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2391  Methyltransferase type 12  48.39 
 
 
442 aa  347  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0920  Methyltransferase type 12  60 
 
 
535 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3568  methyltransferase type 12  44.33 
 
 
202 aa  146  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00317327  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00420  hypothetical protein  27 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3123  hypothetical protein  23.46 
 
 
426 aa  57.4  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000940695  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31991  3,4-dihydroxy-5-hexaprenylbenzoate methyltransferase  31.97 
 
 
280 aa  54.3  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751734  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 
332 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
262 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
318 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  30.15 
 
 
417 aa  44.3  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  39.19 
 
 
262 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>